RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 SP1P08047 785 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 AGAP20933 346 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 SLC35E4Q6ICL7 350 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 MUC15Q8N387 334 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 SLC25A28Q96A46 364 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-202ENST00000402738 A0A1B0GV72 72 aa8.59□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 RNF222A6NCQ9 220 aa8.59□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 CXorf1O96002 111 aa8.59□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 HAND1O96004 215 aa8.59□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 MELTFP08582 738 aa8.59□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 HIKESHIQ53FT3 197 aa8.59□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 OR1N1Q8NGS0 311 aa8.59□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 NAT6Q93015 286 aa8.59□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 OR2J1Q9GZK6 312 aa8.59□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 COA4Q9NYJ1 87 aa8.59□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 DOCK2Q92608 1830 aa8.59□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 PHIPQ8WWQ0 1821 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 OR4C46A6NHA9 309 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 ALG1L2C9J202 215 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 CSRP3P50461 194 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 TNFSF10P50591 281 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 COL10A1Q03692 680 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 SMIM21Q3B7S5 101 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 HES3Q5TGS1 186 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 LURAP1LQ8IV03 231 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 TMEM116Q8NCL8 245 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 Q8WTZ3 238 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 AMELYQ99218 206 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 CCDC88CQ9P219 2028 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 IGHV3-13P01766 116 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 IGHV3-7P01780 117 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 MT-ND6P03923 174 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 PRSS53Q2L4Q9 553 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 TMEM230Q96A57 120 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 RAMP1O60894 148 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 ERASQ7Z444 233 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 OR8B3Q8NGG8 313 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 OR52M1Q8NGK5 317 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 OR10S1Q8NGN2 331 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 OR4A4PQ8NGN8 299 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 SPPL3Q8TCT6 385 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 RNF133Q8WVZ7 376 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 P2RX4Q99571 388 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 CLN8Q9UBY8 286 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 SCN7AQ01118 1682 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 ZNF708P17019 499 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 ORM2P19652 201 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 IGFBP7Q16270 282 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 FDX2Q6P4F2 183 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 KMT5CQ86Y97 462 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 POC1AQ8NBT0 407 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 ZNF519Q8TB69 540 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 AQP3Q92482 292 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 DECR2Q9NUI1 292 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 TRAV39A0A0B4J263 110 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 PDPNQ86YL7 162 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 OR2T6Q8NHC8 308 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 MVB12AQ96EY5 273 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 C14orf144Q96I85 54 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 RBKSQ9H477 322 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 ZNF391Q9UJN7 358 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 ZFP30Q9Y2G7 519 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 LRRC30A6NM36 301 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 HRKO00198 91 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 UPK3AO75631 287 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 COL8A1P27658 744 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 SRIP30626 198 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.57□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 OR2Y1Q8NGV0 311 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 OR2V1Q8NHB1 315 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 MRGPRDQ8TDS7 321 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 R3HDM4Q96D70 268 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 MISP3Q96FF7 219 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 MRGPRX3Q96LB0 322 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 WNT10AQ9GZT5 417 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 A0A0G2JK05 382 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 A6NNC1 897 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 LMX1BO60663 402 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 RBP4P02753 201 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 FGF5P12034 268 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 CCL2P13500 99 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 FSTP19883 344 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 LPAL2Q16609 132 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 OR5A2Q8NGI9 324 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 GALNT14Q96FL9 552 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 AAMDCQ9H7C9 122 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa8.56□□□□□ -1.04
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