RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392919.4

GNPTAB-202, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-202ENST00000392919 NKAPLQ5M9Q1 402 aa22.09■■□□□ 1.13
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF565Q8N9K5 539 aa22.09■■□□□ 1.13
GNPTAB-202ENST00000392919 ETAA1Q9NY74 926 aa22.09■■□□□ 1.13
GNPTAB-202ENST00000392919 SESN1Q9Y6P5 492 aa22.09■■□□□ 1.13
GNPTAB-202ENST00000392919 UBE2QL1A1L167 161 aa22.08■■□□□ 1.13
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
GNPTAB-202ENST00000392919 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
GNPTAB-202ENST00000392919 SOCS1O15524 211 aa22.08■■□□□ 1.13
GNPTAB-202ENST00000392919 TFAP2AP05549 437 aa22.08■■□□□ 1.13
GNPTAB-202ENST00000392919 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
GNPTAB-202ENST00000392919 GDNFP39905 211 aa22.08■■□□□ 1.13
GNPTAB-202ENST00000392919 ALDH3B2P48448 385 aa22.08■■□□□ 1.13
GNPTAB-202ENST00000392919 LSM3P62310 102 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
GNPTAB-202ENST00000392919 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa22.08■■□□□ 1.13
GNPTAB-202ENST00000392919 SFXN4Q6P4A7 337 aa22.08■■□□□ 1.13
GNPTAB-202ENST00000392919 HEPN1Q6WQI6 88 aa22.08■■□□□ 1.13
GNPTAB-202ENST00000392919 RTN4RL2Q86UN3 420 aa22.08■■□□□ 1.13
GNPTAB-202ENST00000392919 GAPTQ8N292 157 aa22.08■■□□□ 1.13
GNPTAB-202ENST00000392919 MRGPRDQ8TDS7 321 aa22.08■■□□□ 1.13
GNPTAB-202ENST00000392919 DYRK2Q92630 601 aa22.08■■□□□ 1.13
GNPTAB-202ENST00000392919 NEDD4LQ96PU5 975 aa22.08■■□□□ 1.13
GNPTAB-202ENST00000392919 SULT4A1Q9BR01 284 aa22.08■■□□□ 1.13
GNPTAB-202ENST00000392919 RAB22AQ9UL26 194 aa22.08■■□□□ 1.13
GNPTAB-202ENST00000392919 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa22.07■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 CDK2P24941 298 aa22.07■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 EFNB2P52799 333 aa22.07■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 RELBQ01201 579 aa22.07■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa22.07■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 C6orf201Q7Z4U5 140 aa22.07■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 LINC00574Q9H8X3 128 aa22.07■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 CALYQ9NYX4 217 aa22.07■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 DAPK2Q9UIK4 370 aa22.07■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 SAA4P35542 130 aa22.06■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 OR13D1Q8NGV5 346 aa22.06■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 CCDC107Q8WV48 283 aa22.06■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 FAAP24Q9BTP7 215 aa22.06■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 MGAM2Q2M2H8 2515 aa22.05■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 POM121CA8CG34 1229 aa22.05■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 CA11O75493 328 aa22.05■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 IGHV4-59P01825 116 aa22.05■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 VEGFCP49767 419 aa22.05■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 TMEM50BP56557 158 aa22.05■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 TMEM86BQ8N661 226 aa22.05■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 AJUBAQ96IF1 538 aa22.05■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 TMEM133Q9H2Q1 129 aa22.05■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 C1RLQ9NZP8 487 aa22.05■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 MEIOCA2RUB1 952 aa22.04■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa22.04■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 IL1AP01583 271 aa22.04■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 RAB6AP20340 208 aa22.04■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 MIDNQ504T8 468 aa22.04■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 OR11H6Q8NGC7 330 aa22.04■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 OR4K15Q8NH41 348 aa22.04■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 C17orf50Q8WW18 174 aa22.04■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 SSMEM1Q8WWF3 244 aa22.04■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 POMT1Q9Y6A1 747 aa22.04■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 ODF3BA8MYP8 253 aa22.03■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 GZMHP20718 246 aa22.03■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 SSTR5P35346 364 aa22.03■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 RPS19P39019 145 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa22.03■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 OR56B1Q8NGI3 324 aa22.03■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 RFESDQ8TAC1 157 aa22.03■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 PTX4Q96A99 478 aa22.03■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 KIRREL1Q96J84 757 aa22.03■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa22.03■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa22.02■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 C15orf65H3BRN8 121 aa22.02■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 PAHP00439 452 aa22.02■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 CRYBA1P05813 215 aa22.02■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 IER3P46695 156 aa22.02■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 RAG2P55895 527 aa22.02■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 NCS1P62166 190 aa22.02■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 PRR31Q5SQ13 230 aa22.02■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 UTF1Q5T230 341 aa22.02■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF626Q68DY1 528 aa22.02■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 OR52W1Q6IF63 320 aa22.02■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 LDLRAD3Q86YD5 345 aa22.02■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa22.02■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa22.02■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa22.02■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa22.02■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 HSF4Q9ULV5 492 aa22.02■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 MMP24Q9Y5R2 645 aa22.02■■□□□ 1.12
GNPTAB-202ENST00000392919 ARG1P05089 322 aa22.01■■□□□ 1.11
GNPTAB-202ENST00000392919 CD34P28906 385 aa22.01■■□□□ 1.11
GNPTAB-202ENST00000392919 MOGAT2Q3SYC2 334 aa22.01■■□□□ 1.11
GNPTAB-202ENST00000392919 PLAC9Q5JTB6 97 aa22.01■■□□□ 1.11
GNPTAB-202ENST00000392919 FAM96BQ9Y3D0 163 aa22.01■■□□□ 1.11
GNPTAB-202ENST00000392919 A0A087X0M5 115 aa22■■□□□ 1.11
GNPTAB-202ENST00000392919 A0A1B0GX30 115 aa22■■□□□ 1.11
GNPTAB-202ENST00000392919 FAM172BPA6NC97 362 aa22■■□□□ 1.11
GNPTAB-202ENST00000392919 ORC5O43913 435 aa22■■□□□ 1.11
GNPTAB-202ENST00000392919 GPR137BO60478 399 aa22■■□□□ 1.11
GNPTAB-202ENST00000392919 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
GNPTAB-202ENST00000392919 VBP1P61758 197 aa22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms