RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327307.11

RRN3-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3, Length 2,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-202ENST00000327307 SEC22AQ96IW7 307 aa5.86□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 APOOQ9BUR5 198 aa5.86□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 COMMD9Q9P000 198 aa5.86□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 HIGD1AQ9Y241 93 aa5.86□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 GAGE12HA6NDE8 117 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 BTNL10A8MVZ5 291 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 GABRPO00591 440 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 EEDO75530 441 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 PLAUP00749 431 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 OR4Q2P0C623 313 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 GKN3PP0CG01 181 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 FAM157CP0CG43 387 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 GLI4P10075 376 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 CD58P19256 250 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 ATP6V0CP27449 155 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 RPL29P47914 159 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 SP4Q02446 784 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 PHLDA2Q53GA4 152 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 GKN2Q86XP6 184 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 C5orf17Q8NAS9 161 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 RHOXF1Q8NHV9 184 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 ZNF519Q8TB69 540 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 SIGLEC10Q96LC7 697 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 TMEM59Q9BXS4 323 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 ULBP3Q9BZM4 244 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 ASIC5Q9NY37 505 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 LAMB1P07942 1786 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 OR2M5A3KFT3 312 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 IFITM10A6NMD0 228 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 J3QR89 54 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 M0R1B8 84 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 SPINT2O43291 252 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 H1F0P07305 194 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 OR5G3P0C626 314 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 FAM106CPP0CH98 169 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 NTF3P20783 257 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 IMPA1P29218 277 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 RARRES1P49788 294 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 SLC35A2P78381 396 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 FAM106AQ4KMX7 169 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 YIPF7Q8N8F6 280 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 LRTM2Q8N967 370 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 OR5AR1Q8NGP9 310 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 MFSD8Q8NHS3 518 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 FNDC9Q8TBE3 224 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 ZPLD1Q8TCW7 415 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 SLC25A19Q9HC21 320 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 SMCO4Q9NRQ5 59 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 PCYOX1Q9UHG3 505 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 SNX11Q9Y5W9 270 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
RRN3-202ENST00000327307 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa5.84□□□□□ -1.48
RRN3-202ENST00000327307 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa5.84□□□□□ -1.48
RRN3-202ENST00000327307 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.48
RRN3-202ENST00000327307 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.48
RRN3-202ENST00000327307 ARPC2O15144 300 aa5.84□□□□□ -1.48
RRN3-202ENST00000327307 IL3P08700 152 aa5.84□□□□□ -1.48
RRN3-202ENST00000327307 OR5AC1P0C628 307 aa5.84□□□□□ -1.48
RRN3-202ENST00000327307 FAM236CP0DP71 79 aa5.84□□□□□ -1.48
RRN3-202ENST00000327307 ZNF19P17023 458 aa5.84□□□□□ -1.48
RRN3-202ENST00000327307 CHRNB2P17787 502 aa5.84□□□□□ -1.48
RRN3-202ENST00000327307 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.48
RRN3-202ENST00000327307 GABRA3P34903 492 aa5.84□□□□□ -1.48
RRN3-202ENST00000327307 ARL2P36404 184 aa5.84□□□□□ -1.48
RRN3-202ENST00000327307 UBE2E1P51965 193 aa5.84□□□□□ -1.48
RRN3-202ENST00000327307 FBXW4P57775 412 aa5.84□□□□□ -1.48
RRN3-202ENST00000327307 ISL1P61371 349 aa5.84□□□□□ -1.48
RRN3-202ENST00000327307 PPP1CBP62140 327 aa5.84□□□□□ -1.48
RRN3-202ENST00000327307 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.48
RRN3-202ENST00000327307 TIGITQ495A1 244 aa5.84□□□□□ -1.48
RRN3-202ENST00000327307 MOB1BQ7L9L4 216 aa5.84□□□□□ -1.48
RRN3-202ENST00000327307 HOGA1Q86XE5 327 aa5.84□□□□□ -1.48
RRN3-202ENST00000327307 GPR135Q8IZ08 494 aa5.84□□□□□ -1.48
RRN3-202ENST00000327307 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa5.84□□□□□ -1.48
RRN3-202ENST00000327307 KLHDC1Q8N7A1 406 aa5.84□□□□□ -1.48
RRN3-202ENST00000327307 SYT8Q8NBV8 401 aa5.84□□□□□ -1.48
RRN3-202ENST00000327307 OR7A2PQ8NGA2 310 aa5.84□□□□□ -1.48
RRN3-202ENST00000327307 OR4F17Q8NGA8 305 aa5.84□□□□□ -1.48
RRN3-202ENST00000327307 PP6455Q8WZ26 134 aa5.84□□□□□ -1.48
RRN3-202ENST00000327307 UBE2E2Q96LR5 201 aa5.84□□□□□ -1.48
RRN3-202ENST00000327307 RDH12Q96NR8 316 aa5.84□□□□□ -1.48
RRN3-202ENST00000327307 OR4F4Q96R69 305 aa5.84□□□□□ -1.48
RRN3-202ENST00000327307 S100A13Q99584 98 aa5.84□□□□□ -1.48
RRN3-202ENST00000327307 MIEN1Q9BRT3 115 aa5.84□□□□□ -1.48
RRN3-202ENST00000327307 DCTN5Q9BTE1 182 aa5.84□□□□□ -1.48
RRN3-202ENST00000327307 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.48
RRN3-202ENST00000327307 OR2H1Q9GZK4 316 aa5.84□□□□□ -1.48
RRN3-202ENST00000327307 AKTIPQ9H8T0 292 aa5.84□□□□□ -1.48
RRN3-202ENST00000327307 C3orf14Q9HBI5 128 aa5.84□□□□□ -1.48
RRN3-202ENST00000327307 ANXA10Q9UJ72 324 aa5.84□□□□□ -1.48
RRN3-202ENST00000327307 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms