RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318978.5

CTXN1-201, Transcript of cortexin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN1, Length 1,274 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1-201ENST00000318978 IGLV1-47P01700 117 aa20.53■□□□□ 0.88
CTXN1-201ENST00000318978 FAM90A15PP0C7V4 464 aa20.53■□□□□ 0.88
CTXN1-201ENST00000318978 FAM90A13PP0C7W8 464 aa20.53■□□□□ 0.88
CTXN1-201ENST00000318978 FAM90A14PP0C7W9 464 aa20.53■□□□□ 0.88
CTXN1-201ENST00000318978 FAM90A24PP0C7X0 464 aa20.53■□□□□ 0.88
CTXN1-201ENST00000318978 HLA-DRB5Q30154 266 aa20.53■□□□□ 0.88
CTXN1-201ENST00000318978 Q96M66 194 aa20.53■□□□□ 0.88
CTXN1-201ENST00000318978 ACOT13Q9NPJ3 140 aa20.53■□□□□ 0.88
CTXN1-201ENST00000318978 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CTXN1-201ENST00000318978 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa20.52■□□□□ 0.88
CTXN1-201ENST00000318978 FUT3P21217 361 aa20.52■□□□□ 0.88
CTXN1-201ENST00000318978 CALRP27797 417 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
CTXN1-201ENST00000318978 HTR2CP28335 458 aa20.52■□□□□ 0.88
CTXN1-201ENST00000318978 GNG10P50151 68 aa20.52■□□□□ 0.88
CTXN1-201ENST00000318978 DYNLT3P51808 116 aa20.52■□□□□ 0.88
CTXN1-201ENST00000318978 PROK1P58294 105 aa20.52■□□□□ 0.88
CTXN1-201ENST00000318978 GABARAPL2P60520 117 aa20.52■□□□□ 0.88
CTXN1-201ENST00000318978 C1orf100Q5SVJ3 147 aa20.52■□□□□ 0.88
CTXN1-201ENST00000318978 UTF1Q5T230 341 aa20.52■□□□□ 0.88
CTXN1-201ENST00000318978 ZNF497Q6ZNH5 498 aa20.52■□□□□ 0.88
CTXN1-201ENST00000318978 ARL11Q969Q4 196 aa20.52■□□□□ 0.88
CTXN1-201ENST00000318978 PLGRKTQ9HBL7 147 aa20.52■□□□□ 0.88
CTXN1-201ENST00000318978 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa20.52■□□□□ 0.88
CTXN1-201ENST00000318978 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
CTXN1-201ENST00000318978 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
CTXN1-201ENST00000318978 UBE2QL1A1L167 161 aa20.51■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 A6NDX4 124 aa20.51■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa20.51■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 DENRO43583 198 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 MT-ND4P03905 459 aa20.51■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 BRS3P32247 399 aa20.51■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 FABP5Q01469 135 aa20.51■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 OR10K2Q6IF99 312 aa20.51■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 SVOPQ8N4V2 548 aa20.51■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 OR10A7Q8NGE5 316 aa20.51■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 OR2T6Q8NHC8 308 aa20.51■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 UBALD1Q8TB05 177 aa20.51■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 MMP28Q9H239 520 aa20.51■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 LINC00574Q9H8X3 128 aa20.51■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 SIGLEC9Q9Y336 463 aa20.51■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 J3QR06 171 aa20.5■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 VSIG8P0DPA2 414 aa20.5■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 NKAPLQ5M9Q1 402 aa20.5■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa20.5■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 DTX3Q8N9I9 347 aa20.5■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 OR6M1Q8NGM8 313 aa20.5■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 OR4K15Q8NH41 348 aa20.5■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 KCNG3Q8TAE7 436 aa20.5■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 TMEM59Q9BXS4 323 aa20.5■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 FBLN5Q9UBX5 448 aa20.5■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 PSG11Q9UQ72 335 aa20.5■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 PDCD6O75340 191 aa20.49■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 KIR2DS4P43632 304 aa20.49■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa20.49■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 RPEQ96AT9 228 aa20.49■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 NEDD4LQ96PU5 975 aa20.49■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 KCNK15Q9H427 330 aa20.49■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 SLC22A1O15245 554 aa20.48■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 ORC5O43913 435 aa20.48■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 GLAP06280 429 aa20.48■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 CD24P25063 80 aa20.48■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 MNDAP41218 407 aa20.48■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 KRTAP10-3P60369 221 aa20.48■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 P2RY14Q15391 338 aa20.48■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa20.48■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 PRR18Q8N4B5 295 aa20.48■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 OR10X1Q8NGY0 326 aa20.48■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 TOMM40LQ969M1 308 aa20.48■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 CITED1Q99966 193 aa20.48■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 BPNT1O95861 308 aa20.47■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 SSX1Q16384 188 aa20.47■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 C6orf183Q5T699 404 aa20.47■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 SIGIRRQ6IA17 410 aa20.47■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 CAPSLQ8WWF8 208 aa20.47■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 ZNF696Q9H7X3 374 aa20.47■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 RAB9BQ9NP90 201 aa20.47■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa20.46■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 A0A1W2PPE3 182 aa20.46■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 LY6LH3BQJ8 138 aa20.46■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 C15orf65H3BRN8 121 aa20.46■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 SLC17A2O00624 439 aa20.46■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 SPINT2O43291 252 aa20.46■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 CA11O75493 328 aa20.46■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 IGHV3-43DP0DP04 118 aa20.46■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 ARSBP15848 533 aa20.46■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 MADCAM1Q13477 382 aa20.46■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 RAB11BQ15907 218 aa20.46■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 GFI1Q99684 422 aa20.46■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CTXN1-201ENST00000318978 OOSP1A8MZH6 123 aa20.45■□□□□ 0.86
CTXN1-201ENST00000318978 UNC119Q13432 240 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms