RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290295.7

HOXB13-201, Transcript of homeobox B13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB13, Length 3,467 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13-201ENST00000290295 BEND2Q8NDZ0 799 aa11.35□□□□□ -0.59
HOXB13-201ENST00000290295 CABLES2Q9BTV7 478 aa11.35□□□□□ -0.59
HOXB13-201ENST00000290295 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa11.35□□□□□ -0.59
HOXB13-201ENST00000290295 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
HOXB13-201ENST00000290295 A0A1W2PNV4 684 aa11.35□□□□□ -0.59
HOXB13-201ENST00000290295 HSPB6O14558 160 aa11.35□□□□□ -0.59
HOXB13-201ENST00000290295 IL13RA2Q14627 380 aa11.35□□□□□ -0.59
HOXB13-201ENST00000290295 BRICD5Q6PL45 260 aa11.35□□□□□ -0.59
HOXB13-201ENST00000290295 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
HOXB13-201ENST00000290295 SLC35E3Q7Z769 313 aa11.35□□□□□ -0.59
HOXB13-201ENST00000290295 KCNE4Q8WWG9 221 aa11.35□□□□□ -0.59
HOXB13-201ENST00000290295 REEP6Q96HR9 211 aa11.35□□□□□ -0.59
HOXB13-201ENST00000290295 ZPBPQ9BS86 351 aa11.35□□□□□ -0.59
HOXB13-201ENST00000290295 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
HOXB13-201ENST00000290295 SRXN1Q9BYN0 137 aa11.35□□□□□ -0.59
HOXB13-201ENST00000290295 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
HOXB13-201ENST00000290295 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa11.34□□□□□ -0.59
HOXB13-201ENST00000290295 B4E171 279 aa11.34□□□□□ -0.59
HOXB13-201ENST00000290295 ST8SIA3O43173 380 aa11.34□□□□□ -0.59
HOXB13-201ENST00000290295 HPNP05981 417 aa11.34□□□□□ -0.59
HOXB13-201ENST00000290295 OPRM1P35372 400 aa11.34□□□□□ -0.59
HOXB13-201ENST00000290295 TSPAN7P41732 249 aa11.34□□□□□ -0.59
HOXB13-201ENST00000290295 PIGPP57054 158 aa11.34□□□□□ -0.59
HOXB13-201ENST00000290295 RAB11AP62491 216 aa11.34□□□□□ -0.59
HOXB13-201ENST00000290295 PMS2P11Q13670 270 aa11.34□□□□□ -0.59
HOXB13-201ENST00000290295 SPSB3Q6PJ21 355 aa11.34□□□□□ -0.59
HOXB13-201ENST00000290295 PRO3102Q9H379 93 aa11.34□□□□□ -0.59
HOXB13-201ENST00000290295 FOXJ2Q9P0K8 574 aa11.34□□□□□ -0.59
HOXB13-201ENST00000290295 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa11.34□□□□□ -0.59
HOXB13-201ENST00000290295 CD46P15529 392 aa11.34□□□□□ -0.59
HOXB13-201ENST00000290295 PCBD1P61457 104 aa11.34□□□□□ -0.59
HOXB13-201ENST00000290295 HLA-DRB3P79483 266 aa11.34□□□□□ -0.59
HOXB13-201ENST00000290295 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa11.34□□□□□ -0.59
HOXB13-201ENST00000290295 LYZL2Q7Z4W2 148 aa11.34□□□□□ -0.59
HOXB13-201ENST00000290295 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa11.34□□□□□ -0.59
HOXB13-201ENST00000290295 ROS1P08922 2347 aa11.34□□□□□ -0.59
HOXB13-201ENST00000290295 LRP4O75096 1905 aa11.34□□□□□ -0.59
HOXB13-201ENST00000290295 AMBPP02760 352 aa11.34□□□□□ -0.59
HOXB13-201ENST00000290295 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
HOXB13-201ENST00000290295 MMP9P14780 707 aa11.34□□□□□ -0.59
HOXB13-201ENST00000290295 ATP6V0CP27449 155 aa11.34□□□□□ -0.59
HOXB13-201ENST00000290295 MAGEA5P43359 124 aa11.34□□□□□ -0.59
HOXB13-201ENST00000290295 PAX5Q02548 391 aa11.34□□□□□ -0.59
HOXB13-201ENST00000290295 ZNF266Q14584 549 aa11.34□□□□□ -0.59
HOXB13-201ENST00000290295 GNMTQ14749 295 aa11.34□□□□□ -0.59
HOXB13-201ENST00000290295 ICAM4Q14773 271 aa11.34□□□□□ -0.59
HOXB13-201ENST00000290295 C20orf196Q8IYI0 205 aa11.34□□□□□ -0.59
HOXB13-201ENST00000290295 OR10S1Q8NGN2 331 aa11.34□□□□□ -0.59
HOXB13-201ENST00000290295 PECRQ9BY49 303 aa11.34□□□□□ -0.59
HOXB13-201ENST00000290295 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa11.33□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 XKRY2A2RUG3 117 aa11.33□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 OR5AC1P0C628 307 aa11.33□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 DUSP1P28562 367 aa11.33□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 C5orf24Q7Z6I8 188 aa11.33□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 OR8G5Q8NG78 346 aa11.33□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 CPT1CQ8TCG5 803 aa11.33□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 ELOVL1Q9BW60 279 aa11.33□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 ZNF319Q9P2F9 582 aa11.33□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 NBASA2RRP1 2371 aa11.33□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa11.33□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 B4DEV8 164 aa11.33□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 HLA-HP01893 362 aa11.33□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 OR4A8P0C604 315 aa11.33□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 H3F3AP84243 136 aa11.33□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP11.33□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 MALLQ13021 153 aa11.33□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 OR5I1Q13606 314 aa11.33□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 SPIN3Q5JUX0 258 aa11.33□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 PHYHD1Q5SRE7 291 aa11.33□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 TMEM183AQ8IXX5 376 aa11.33□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 OR1F12Q8NHA8 337 aa11.33□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa11.33□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 DHRS3O75911 302 aa11.33□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 FUT3P21217 361 aa11.33□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 CDCP2Q5VXM1 449 aa11.33□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 FADS6Q8N9I5 356 aa11.33□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 OR52M1Q8NGK5 317 aa11.33□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 TMEM37Q8WXS4 190 aa11.33□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 FAM173AQ9BQD7 235 aa11.33□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 CACNA1DQ01668 2161 aa11.33□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 C5orf49A4QMS7 147 aa11.32□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 SERPINE3A8MV23 424 aa11.32□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa11.32□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 CLDN34H7C241 214 aa11.32□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 HSPA12AO43301 675 aa11.32□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 HERPUD1Q15011 391 aa11.32□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 ANKRD39Q53RE8 183 aa11.32□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 ZNF506Q5JVG8 444 aa11.32□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 DCAF10Q5QP82 559 aa11.32□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa11.32□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 BTNL3Q6UXE8 466 aa11.32□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa11.32□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 NAA60Q9H7X0 242 aa11.32□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 DHRS7CA6NNS2 312 aa11.32□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 NRASP01111 189 aa11.32□□□□□ -0.6
HOXB13-201ENST00000290295 CST2P09228 141 aa11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms