RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 GABRA6Q16445 453 aa17.43■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF343Q6P1L6 599 aa17.43■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 FGGYQ96C11 551 aa17.43■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 VKORC1Q9BQB6 163 aa17.43■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 C5orf66Q9H5L9 145 aa17.43■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa17.43■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 F5H5K5 113 aa17.43■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 GNB3P16520 340 aa17.43■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 FCGR2CP31995 323 aa17.43■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 CA7P43166 264 aa17.43■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 CAMLGP49069 296 aa17.43■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 LYPD6Q86Y78 171 aa17.43■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 COMMD1Q8N668 190 aa17.43■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF283Q8N7M2 679 aa17.43■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 MEMO1Q9Y316 297 aa17.43■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 K7EPK0 472 aa17.42■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 G0S2P27469 103 aa17.42■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 OPRM1P35372 400 aa17.42■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 GNALP38405 381 aa17.42■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 UNC119Q13432 240 aa17.42■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa17.42■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 POC1AQ8NBT0 407 aa17.42■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 OR4K15Q8NH41 348 aa17.42■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 RAB22AQ9UL26 194 aa17.42■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 OSGIN2Q9Y236 505 aa17.42■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 CXCL1P09341 107 aa17.42■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 CHATP28329 748 aa17.42■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 OR10AD1Q8NGE0 317 aa17.42■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 OR52N4Q8NGI2 321 aa17.42■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 TERB2Q8NHR7 220 aa17.42■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 PTX4Q96A99 478 aa17.42■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 PBOV1Q9GZY1 135 aa17.42■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 CACNA1BQ00975 2339 aa17.41■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 COL6A6A6NMZ7 2263 aa17.41■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 POLEQ07864 2286 aa17.41■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 IGSF10Q6WRI0 2623 aa17.41■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM33P57088 247 aa17.41■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 UBE2V2Q15819 145 aa17.41■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa17.41■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 SOHLH1Q5JUK2 328 aa17.41■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 A0A1W2PR80 420 aa17.41■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 M0R135 149 aa17.41■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 PHOX2AO14813 284 aa17.41■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 TTRP02766 147 aa17.41■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 ISG15P05161 165 aa17.41■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 THBS4P35443 961 aa17.41■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 FAM3AP98173 230 aa17.41■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 P2RY6Q15077 328 aa17.41■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 DNLZQ5SXM8 178 aa17.41■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 NKAIN3Q8N8D7 197 aa17.41■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 Q8WTZ3 238 aa17.41■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 SPTSSAQ969W0 71 aa17.41■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF799Q96GE5 643 aa17.41■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 RTTNQ86VV8 2226 aa17.4■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 C1QL1O75973 258 aa17.4■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 PRH1P02810 166 aa17.4■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 ARR3P36575 388 aa17.4■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 CD81P60033 236 aa17.4■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 OR8B12Q8NGG6 310 aa17.4■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 BOD1Q96IK1 185 aa17.4■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 ATG101Q9BSB4 218 aa17.4■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 MOB1AQ9H8S9 216 aa17.4■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF319Q9P2F9 582 aa17.4■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 C5orf63A6NC05 138 aa17.4■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 MSTNO14793 375 aa17.4■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 FAM57BQ71RH2 274 aa17.4■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 MDP1Q86V88 176 aa17.4■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 GPR132Q9UNW8 380 aa17.4■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 TMED3Q9Y3Q3 217 aa17.4■□□□□ 0.38
UBE2B-201ENST00000265339 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
UBE2B-201ENST00000265339 TRGC2P03986 189 aa17.39■□□□□ 0.37
UBE2B-201ENST00000265339 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
UBE2B-201ENST00000265339 VSIG8P0DPA2 414 aa17.39■□□□□ 0.37
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM211Q6ICI0 200 aa17.39■□□□□ 0.37
UBE2B-201ENST00000265339 OR2T2Q6IF00 324 aa17.39■□□□□ 0.37
UBE2B-201ENST00000265339 SUMF2Q8NBJ7 301 aa17.39■□□□□ 0.37
UBE2B-201ENST00000265339 RND1Q92730 232 aa17.39■□□□□ 0.37
UBE2B-201ENST00000265339 PBDC1Q9BVG4 233 aa17.39■□□□□ 0.37
UBE2B-201ENST00000265339 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
UBE2B-201ENST00000265339 A8MXE2 369 aa17.39■□□□□ 0.37
UBE2B-201ENST00000265339 HCKP08631 526 aa17.39■□□□□ 0.37
UBE2B-201ENST00000265339 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
UBE2B-201ENST00000265339 ELOBQ15370 118 aa17.39■□□□□ 0.37
UBE2B-201ENST00000265339 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa17.39■□□□□ 0.37
UBE2B-201ENST00000265339 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
UBE2B-201ENST00000265339 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
UBE2B-201ENST00000265339 C19orf12Q9NSK7 152 aa17.39■□□□□ 0.37
UBE2B-201ENST00000265339 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa17.39■□□□□ 0.37
UBE2B-201ENST00000265339 CYB5BO43169 146 aa17.38■□□□□ 0.37
UBE2B-201ENST00000265339 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
UBE2B-201ENST00000265339 DANCRP0C864 163 aa17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms