RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000171887.8

TNS1-201, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 10,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-201ENST00000171887 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa8.22□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 LINC01553A4QN01 128 aa8.22□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 IGHV3-43DP0DP04 118 aa8.22□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 SYT8Q8NBV8 401 aa8.22□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa8.21□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 GAB4Q2WGN9 574 aa8.21□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 ZNF774Q6NX45 483 aa8.21□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 MMP17Q9ULZ9 603 aa8.21□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 KCNE3Q9Y6H6 103 aa8.21□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 DENND4AQ7Z401 1863 aa8.21□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 GFYI3L273 518 aa8.21□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP8.21□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 PLPP2O43688 288 aa8.21□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 CXCL13O43927 109 aa8.21□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 LRP10Q7Z4F1 713 aa8.21□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 NEU3Q9UQ49 428 aa8.21□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 A0A0B4J2E0 115 aa8.21□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 A0A1B0GX12 115 aa8.21□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 LDLRAD3Q86YD5 345 aa8.21□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 RFESDQ8TAC1 157 aa8.21□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
TNS1-201ENST00000171887 F11P03951 625 aa8.21□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 MMP9P14780 707 aa8.21□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 RTP5Q14D33 572 aa8.21□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 XAF1Q6GPH4 301 aa8.21□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 FADS6Q8N9I5 356 aa8.21□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 ZGLP1P0C6A0 271 aa8.21□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 DEFB103AP81534 67 aa8.21□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 GCSAMLQ5JQS6 135 aa8.21□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 GFRALQ6UXV0 394 aa8.21□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 FAM219AQ8IW50 185 aa8.21□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 VN1R2Q8NFZ6 395 aa8.21□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 CLEC1BQ9P126 229 aa8.21□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 FCMRO60667 390 aa8.21□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 DPTQ07507 201 aa8.21□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 TMEM183AQ8IXX5 376 aa8.21□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 SGMS2Q8NHU3 365 aa8.21□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 TMUB1Q9BVT8 246 aa8.21□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa8.21□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 KBTBD11O94819 623 aa8.21□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 MT-CO3P00414 261 aa8.21□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 PLPPR5Q32ZL2 321 aa8.21□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 PYCR3Q53H96 274 aa8.21□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 KIRREL2Q6UWL6 708 aa8.21□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa8.21□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 ZBTB42B2RXF5 422 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 C3orf80F5H4A9 247 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 PDCD1Q15116 288 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 OR8B3Q8NGG8 313 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 OR5M9Q8NGP3 310 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 OR4X1Q8NH49 305 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 LHFPL5Q8TAF8 219 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 DEFB109BQ30KR1 87 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 FAM222BQ8WU58 562 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 IGHV3-13P01766 116 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 IGHV3-7P01780 117 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 CRHP06850 196 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 BCL2P10415 239 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 SLC25A34Q6PIV7 304 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 CCL17Q92583 94 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 RAB33BQ9H082 229 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 IL20Q9NYY1 176 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 LRRC29Q8WV35 223 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 SLC26A1Q9H2B4 701 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 PRNDQ9UKY0 176 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 MTCH2Q9Y6C9 303 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 LOC285556D6RIA3 1793 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 IL4P05112 153 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 TM4SF19Q96DZ7 209 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 TBX21Q9UL17 535 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 H3BMH7 237 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 CHST1O43916 411 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 SMIM13P0DJ93 91 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 LYPD8Q6UX82 237 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 HIGD1AQ9Y241 93 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 A0A0A6YYD5 115 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 ALG1L2C9J202 215 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 H0Y8X5 98 aa8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
TNS1-201ENST00000171887 PPP1R17O96001 155 aa8.2□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms