RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	FHIT	P49789	147 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	MDS2	Q8NDY4	140 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	SNX22	Q96L94	193 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	RARRES2	Q99969	163 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	CENPM	Q9NSP4	180 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	CACNA1C	Q13936	2221 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	MED13	Q9UHV7	2174 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM210	A6NLX4	147 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	CDA	P32320	146 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	PDLIM4	P50479	330 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	CLN3	Q13286	438 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM123	Q8N131	208 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	OR10D3	Q8NH80	312 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM18	Q96B42	140 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	TTTY12	Q9BZ98	90 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	PTPRB	P23467	1997 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659		H0YL77	283 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	NKX2-8	O15522	239 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	GLRA1	P23415	457 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	PTGER4	P35408	488 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	CLDN15	P56746	228 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	PLGLB1	Q02325	96 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	C10orf128	Q5T292	105 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF573	Q86YE8	665 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	SLC35G3	Q8N808	338 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	WFDC1	Q9HC57	220 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	PRR13	Q9NZ81	148 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	EHF	Q9NZC4	300 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	CNTRL	Q7Z7A1	2325 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	FAM166B	A8MTA8	275 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	IL18BP	O95998	194 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	CD46	P15529	392 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	PI3	P19957	117 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	ICAM4	Q14773	271 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	PRR18	Q8N4B5	295 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	LRTM2	Q8N967	370 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	GPR84	Q9NQS5	396 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659		A0A1B0GU03	582 aa		13.21	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF716	A6NP11	495 aa		13.21	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	CELA3A	P09093	270 aa		13.21	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	PGA5	P0DJD9	388 aa		13.21	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	GNAL	P38405	381 aa		13.21	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	MEOX1	P50221	254 aa		13.21	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	TLE4	Q04727	773 aa		13.21	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	ARFRP1	Q13795	201 aa		13.21	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		13.21	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		13.21	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		13.21	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		13.21	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		13.21	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		13.21	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		13.21	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	ATG101	Q9BSB4	218 aa		13.21	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		13.21	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		13.21	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	DECR2	Q9NUI1	292 aa		13.21	□□□□□ -0.29
BBS1-225	ENST00000630659	ST8SIA3	O43173	380 aa		13.21	□□□□□ -0.3

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