RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF788Q6ZQV5 615 aa20.78■□□□□ 0.92
CAPNS1-215ENST00000628018 CLEC18CQ8NCF0 446 aa20.78■□□□□ 0.92
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CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC107Q8WV48 283 aa20.78■□□□□ 0.92
CAPNS1-215ENST00000628018 DSCAMO60469 2012 aa20.78■□□□□ 0.92
CAPNS1-215ENST00000628018 FABP7O15540 132 aa20.78■□□□□ 0.92
CAPNS1-215ENST00000628018 GYPAP02724 150 aa20.78■□□□□ 0.92
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CAPNS1-215ENST00000628018 COL12A1Q99715 3063 aa20.72■□□□□ 0.91
CAPNS1-215ENST00000628018 IL5P05113 134 aa20.72■□□□□ 0.91
CAPNS1-215ENST00000628018 FCGR2CP31995 323 aa20.72■□□□□ 0.91
CAPNS1-215ENST00000628018 GLP1RP43220 463 aa20.72■□□□□ 0.91
CAPNS1-215ENST00000628018 NPY4RP50391 375 aa20.72■□□□□ 0.91
CAPNS1-215ENST00000628018 EDDM3AQ14507 147 aa20.72■□□□□ 0.91
CAPNS1-215ENST00000628018 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
CAPNS1-215ENST00000628018 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
CAPNS1-215ENST00000628018 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
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