RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590619.1

DNMT1-222, Transcript of DNA methyltransferase 1, human

TSL 1 (best)

Gene DNMT1, Length 231 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DNMT1-222	ENST00000590619	RDH10	Q8IZV5	341 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNMT1-222	ENST00000590619	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNMT1-222	ENST00000590619	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNMT1-222	ENST00000590619	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNMT1-222	ENST00000590619	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNMT1-222	ENST00000590619	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNMT1-222	ENST00000590619	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
DNMT1-222	ENST00000590619	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNMT1-222	ENST00000590619	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNMT1-222	ENST00000590619	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
DNMT1-222	ENST00000590619	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
DNMT1-222	ENST00000590619	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNMT1-222	ENST00000590619	CALY	Q9NYX4	217 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNMT1-222	ENST00000590619	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNMT1-222	ENST00000590619	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
DNMT1-222	ENST00000590619	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNMT1-222	ENST00000590619	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNMT1-222	ENST00000590619	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNMT1-222	ENST00000590619		V9GYS6	101 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNMT1-222	ENST00000590619	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	FXYD1	O00168	92 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	CXCR6	O00574	342 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	FCN1	O00602	326 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	DIRAS1	O95057	198 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	IL1A	P01583	271 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	CSN2	P05814	226 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	PRKACA	P17612	351 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	HCCS	P53701	268 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	CX3CL1	P78423	397 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	SCN1B	Q07699	218 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	MMD	Q15546	238 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	GUCA2B	Q16661	112 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	DEFB135	Q30KP9	77 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	TMEM177	Q53S58	311 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619		Q6P435	159 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	LINC00311	Q8N616	119 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	OTOS	Q8NHW6	89 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	MED20	Q9H944	212 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	HMG20A	Q9NP66	347 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	KRT84	Q9NSB2	600 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	AGRN	O00468	2067 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619		A0A1B0GTI1	187 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	TRBV12-3	P01733	135 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	TTR	P02766	147 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	TRGV3	P03979	118 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	ALOX5AP	P20292	161 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	ALDH3A2	P51648	485 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	FUT6	P51993	359 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	MFAP2	P55001	183 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	ACTB	P60709	375 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	TSPAN31	Q12999	210 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	ACTBL2	Q562R1	376 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	FAHD1	Q6P587	224 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619		Q6ZR54	194 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619		Q6ZSR3	168 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619		Q8IYB0	196 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	NPB	Q8NG41	125 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	OR2T12	Q8NG77	320 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	C7orf34	Q96L11	122 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	MFF	Q9GZY8	342 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	IL20	Q9NYY1	176 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	KIF25	Q9UIL4	384 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	FAT1	Q14517	4588 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	UBE2C	O00762	179 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	DEGS1	O15121	323 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNMT1-222	ENST00000590619	AIRE	O43918	545 aa		4.75	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms