RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589626.5

FBXL12-208, Transcript of F-box and leucine rich repeat protein 12, human

TSL 2 BASIC

Gene FBXL12, Length 1,920 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXL12-208	ENST00000589626	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626	HAAO	P46952	286 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626	NPBWR2	P48146	333 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626	TBR1	Q16650	682 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626	OR2C3	Q8N628	320 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626	BOD1	Q96IK1	185 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626	TMEM56	Q96MV1	263 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626	OPA3	Q9H6K4	179 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626	WFDC1	Q9HC57	220 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626		Q9N2K0	584 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626	PINLYP	A6NC86	204 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626	F10	P00742	488 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626	IGHV3-9	P01782	118 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626	CRYBA1	P05813	215 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626	FOLR2	P14207	255 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626	BCL3	P20749	454 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626	CCNO	P22674	350 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626	AKR1D1	P51857	326 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626	RAB5B	P61020	215 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	13.53	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626	IGSF11	Q5DX21	431 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626	LINC00596	Q86U02	117 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626	SLAMF9	Q96A28	289 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626	PLK3	Q9H4B4	646 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626	RNF122	Q9H9V4	155 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626		C9JQL5	133 aa		13.52	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626	S100G	P29377	79 aa		13.52	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626	GNRHR	P30968	328 aa		13.52	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626	SPINK14	Q6IE38	97 aa		13.52	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		13.52	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626	SLC39A7	Q92504	469 aa		13.52	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		13.52	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		13.52	□□□□□ -0.24
FBXL12-208	ENST00000589626	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FBXL12-208	ENST00000589626	C5orf49	A4QMS7	147 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FBXL12-208	ENST00000589626	PITX3	O75364	302 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FBXL12-208	ENST00000589626	NAPSA	O96009	420 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FBXL12-208	ENST00000589626	ARR3	P36575	388 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FBXL12-208	ENST00000589626	GPM6A	P51674	278 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FBXL12-208	ENST00000589626	VAMP2	P63027	116 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FBXL12-208	ENST00000589626	NHLH2	Q02577	135 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FBXL12-208	ENST00000589626		Q6ZPA2	131 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FBXL12-208	ENST00000589626	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FBXL12-208	ENST00000589626	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FBXL12-208	ENST00000589626	OR2M7	Q8NG81	312 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FBXL12-208	ENST00000589626	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FBXL12-208	ENST00000589626	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
FBXL12-208	ENST00000589626	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FBXL12-208	ENST00000589626	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FBXL12-208	ENST00000589626	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
FBXL12-208	ENST00000589626	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FBXL12-208	ENST00000589626	COLCA2	A8K830	154 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FBXL12-208	ENST00000589626	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FBXL12-208	ENST00000589626	HSPA12A	O43301	675 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FBXL12-208	ENST00000589626	NEURL1	O76050	574 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FBXL12-208	ENST00000589626	IFNA4	P05014	189 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FBXL12-208	ENST00000589626	KCNJ3	P48549	501 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FBXL12-208	ENST00000589626	LHX2	P50458	406 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FBXL12-208	ENST00000589626	ARG2	P78540	354 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FBXL12-208	ENST00000589626	SRY	Q05066	204 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FBXL12-208	ENST00000589626	OR1C1	Q15619	314 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FBXL12-208	ENST00000589626	NEK7	Q8TDX7	302 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FBXL12-208	ENST00000589626	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FBXL12-208	ENST00000589626	SIGLEC12	Q96PQ1	595 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FBXL12-208	ENST00000589626		A0A096LPE4	126 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FBXL12-208	ENST00000589626		A0A1W2PPZ6	126 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FBXL12-208	ENST00000589626	UMAD1	C9J7I0	102 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FBXL12-208	ENST00000589626	MMP9	P14780	707 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FBXL12-208	ENST00000589626	PLP2	Q04941	152 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FBXL12-208	ENST00000589626	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
FBXL12-208	ENST00000589626	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FBXL12-208	ENST00000589626	BATF2	Q8N1L9	274 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FBXL12-208	ENST00000589626	OR8G5	Q8NG78	346 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FBXL12-208	ENST00000589626	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FBXL12-208	ENST00000589626	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
FBXL12-208	ENST00000589626	C14orf79	Q96F83	325 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FBXL12-208	ENST00000589626	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FBXL12-208	ENST00000589626	TUBA4B	Q9H853	241 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FBXL12-208	ENST00000589626	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FBXL12-208	ENST00000589626	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
FBXL12-208	ENST00000589626	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FBXL12-208	ENST00000589626		A0A1B0GW64	132 aa		13.5	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms