RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586900.1

PKN1-208, Transcript of protein kinase N1, human

TSL 3

Gene PKN1, Length 550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKN1-208	ENST00000586900	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	VEGFC	P49767	419 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	EFNB2	P52799	333 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	TMEM50B	P56557	158 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	PLA2G7	Q13093	441 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	BRICD5	Q6PL45	260 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900		Q6ZTK2	550 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	NEK7	Q8TDX7	302 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	ETAA1	Q9NY74	926 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	SPATA2	Q9UM82	520 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	POM121C	A8CG34	1229 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	RAB27B	O00194	218 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	PAH	P00439	452 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	CCL3L1	P16619	93 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	GZMH	P20718	246 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	RORC	P51449	518 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	ERVFRD-1	P60508	538 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	SCGB2A2	Q13296	93 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	ARL6IP1	Q15041	203 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	TNFRSF14	Q92956	283 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	NUP50	Q9UKX7	468 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900		A0A0A6YYH2	397 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	UBE2QL1	A1L167	161 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900		A6NJ64	397 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	FAM157C	P0CG43	387 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	SRD5A1	P18405	259 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	GUCA2A	Q02747	115 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	GPR157	Q5UAW9	335 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	NDNF	Q8TB73	568 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	ISOC1	Q96CN7	298 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	RAB3C	Q96E17	227 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	CMTM3	Q96MX0	182 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	PECR	Q9BY49	303 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	ABCG5	Q9H222	651 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	10.1	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	ING3	Q9NXR8	418 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900		H3BMQ9	156 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	ORC5	O43913	435 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	CLPX	O76031	633 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	NAPSA	O96009	420 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	UBE2E1	P51965	193 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	SPCS2	Q15005	226 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	OR52W1	Q6IF63	320 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	AP3S1	Q92572	193 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	DYRK2	Q92630	601 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	LHX4	Q969G2	390 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	RAB9B	Q9NP90	201 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	CALY	Q9NYX4	217 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PKN1-208	ENST00000586900	ZFHX3	Q15911	3703 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PKN1-208	ENST00000586900	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PKN1-208	ENST00000586900	SERPINE3	A8MV23	424 aa		10.08	□□□□□ -0.8

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