RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580713.1

TOP3A-210, Transcript of DNA topoisomerase III alpha, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3A, Length 474 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3A-210ENST00000580713 CEACAM21Q3KPI0 293 aa8.69□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 C1orf100Q5SVJ3 147 aa8.69□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 NCR3LG1Q68D85 454 aa8.69□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa8.69□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 OR6M1Q8NGM8 313 aa8.69□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 ZNF671Q8TAW3 534 aa8.69□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 TSC22D3Q99576 134 aa8.69□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa8.69□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 SLC22A4Q9H015 551 aa8.69□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa8.69□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 ZNF702PQ9H963 129 aa8.69□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 LIN7BQ9HAP6 207 aa8.69□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 SERTAD4Q9NUC0 356 aa8.69□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 ABRACLQ9P1F3 81 aa8.69□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 COMMD3Q9UBI1 195 aa8.69□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 DUX4Q9UBX2 424 aa8.69□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 PEX16Q9Y5Y5 336 aa8.69□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 A0A0B4J203 849 aa8.68□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 RGS5O15539 181 aa8.68□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 CALCBP10092 127 aa8.68□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 CAPZA1P52907 286 aa8.68□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 MTCP1P56278 107 aa8.68□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 CLDN12P56749 244 aa8.68□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 P2RY14Q15391 338 aa8.68□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 MICBQ29980 383 aa8.68□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 CRIP3Q6Q6R5 217 aa8.68□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 LYPD6Q86Y78 171 aa8.68□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 GCSAMQ8N6F7 178 aa8.68□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 FAM216BQ8N7L0 139 aa8.68□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 OR5A2Q8NGI9 324 aa8.68□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 OR4D6Q8NGJ1 314 aa8.68□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa8.68□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 OR8S1Q8NH09 359 aa8.68□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 C8orf46Q8TAG6 207 aa8.68□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 LGALS14Q8TCE9 139 aa8.68□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 HPSE2Q8WWQ2 592 aa8.68□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 OR5P3Q8WZ94 311 aa8.68□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 TNFRSF14Q92956 283 aa8.68□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 RFT1Q96AA3 541 aa8.68□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 RNF170Q96K19 258 aa8.68□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 MICU1Q9BPX6 476 aa8.68□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 RTL8AQ9BWD3 113 aa8.68□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa8.67□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa8.67□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 A0A1W2PQ09 198 aa8.67□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 PQLC2LA1A4F0 135 aa8.67□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 OR5B21A6NL26 309 aa8.67□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 ZNF732B4DXR9 585 aa8.67□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 CTDSP2O14595 271 aa8.67□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 ANGPTL7O43827 346 aa8.67□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 ARSBP15848 533 aa8.67□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 OR3A4PP47883 348 aa8.67□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 GPM6AP51674 278 aa8.67□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 SCAND1P57086 179 aa8.67□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 GNG3P63215 75 aa8.67□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 LSAMPQ13449 338 aa8.67□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 LRRC10Q5BKY1 277 aa8.67□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 TEX36Q5VZQ5 186 aa8.67□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 AWAT2Q6E213 333 aa8.67□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 LINC00299Q6ZSB3 139 aa8.67□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 ANGPTL5Q86XS5 388 aa8.67□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 SAMD12Q8N8I0 201 aa8.67□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 OR51D1Q8NGF3 324 aa8.67□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 OR5H6Q8NGV6 325 aa8.67□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa8.67□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 RYR2Q92736 4967 aa8.67□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 FAM3DQ96BQ1 224 aa8.67□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 CEP19Q96LK0 163 aa8.67□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 S100A13Q99584 98 aa8.67□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 PRSS22Q9GZN4 317 aa8.67□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 MEGF9Q9H1U4 602 aa8.67□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 ADAM30Q9UKF2 790 aa8.67□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 SPATA2Q9UM82 520 aa8.67□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 ETV7Q9Y603 341 aa8.67□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 TMEM210A6NLX4 147 aa8.66□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 HPGDSO60760 199 aa8.66□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 BPNT1O95861 308 aa8.66□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 UBBP0CG47 229 aa8.66□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 VAMP1P23763 118 aa8.66□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 LMO1P25800 156 aa8.66□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 PTGFRP43088 359 aa8.66□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 POU3F4P49335 361 aa8.66□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 ZP1P60852 638 aa8.66□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 MZT1Q08AG7 82 aa8.66□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa8.66□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 AANATQ16613 207 aa8.66□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 C2orf76Q3KRA6 126 aa8.66□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 UBE2NLQ5JXB2 153 aa8.66□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 CASC10Q5T4H9 136 aa8.66□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa8.66□□□□□ -1.02
TOP3A-210ENST00000580713 ZNF573Q86YE8 665 aa8.66□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms