RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 MECP2P51608 486 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 FUT6P51993 359 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 CDC42P60953 191 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 ROM1Q03395 351 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 FHL3Q13643 280 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 C16orf89Q6UX73 402 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 FAM58AQ8N1B3 248 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 OR9G1Q8NH87 305 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 SETD6Q8TBK2 473 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 ASB17Q8WXJ9 295 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 CMTM5Q96DZ9 223 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 TM2D3Q9BRN9 247 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 TTTY10Q9BZA0 68 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 RIBC2Q9H4K1 309 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 MOB1AQ9H8S9 216 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 PLEKHA1Q9HB21 404 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 OR52A1Q9UKL2 312 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 A0A1B0GTI1 187 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 A0A1W2PPI3 338 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 ODAMA1E959 279 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 DHRS7CA6NNS2 312 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 PRR32B1ATL7 298 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 SH2D1BO14796 132 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 ENTPD6O75354 484 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 GATBO75879 557 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 SASH3O75995 380 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 DIRAS3O95661 229 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 HMGN1P05114 100 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 HSD17B1P14061 328 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 SPNP16150 400 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 PRKACAP17612 351 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 BCL3P20749 454 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 S100A1P23297 94 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 NPBWR2P48146 333 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 POU3F4P49335 361 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 VEGFCP49767 419 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 RAB7AP51149 207 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 ACTR3P61158 418 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 AESQ08117 197 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 MADCAM1Q13477 382 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 APOFQ13790 326 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 GINS1Q14691 196 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF146Q15072 292 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 UBE2V2Q15819 145 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM177Q53S58 311 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 SPIN3Q5JUX0 258 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 CD300LDQ6UXZ3 194 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 TPRA1Q86W33 373 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 ELMOD2Q8IZ81 293 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 BBS1Q8NFJ9 593 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 OR10G2Q8NGC3 310 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 OR1N2Q8NGR9 330 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 RNF125Q96EQ8 232 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 BORCS8Q96FH0 119 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 ABCG5Q9H222 651 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 REEP1Q9H902 201 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 ISYNA1Q9NPH2 558 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 ING3Q9NXR8 418 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 R4GMQ9 66 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 AQP12BA6NM10 295 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 H0Y8G0 127 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 H3BSH0 61 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 J3QR06 171 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 OVOL1O14753 267 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 MPZL2O60487 215 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 SAP30O75446 220 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 OR2H2O95918 312 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 SERPINA3P01011 423 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 IGHV3-7P01780 117 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 VDAC1P21796 283 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 SLC2A5P22732 501 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 MTNR1BP49286 362 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 ATP1B3P54709 279 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 C17orf58Q2M2W7 97 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 UTF1Q5T230 341 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 OR2T5Q6IEZ7 315 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 Q6ZSR3 168 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 MOB3BQ86TA1 216 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 SLC24A4Q8NFF2 622 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 OR2T29Q8NH02 315 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 APOL4Q9BPW4 351 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 SLC5A7Q9GZV3 580 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 COPS3Q9UNS2 423 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-210ENST00000578916 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa7.09□□□□□ -1.27
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