RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559460.5

SMAD3-211, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-211ENST00000559460 DYNLRB2Q8TF09 96 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 DHRS1Q96LJ7 313 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 MS4A10Q96PG2 267 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 SPACA5Q96QH8 159 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF251Q9BRH9 671 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 FUZQ9BT04 418 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 OSBPL10Q9BXB5 764 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 WFDC10AQ9H1F0 79 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 SLA2Q9H6Q3 261 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 MOB1AQ9H8S9 216 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 MED20Q9H944 212 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 MRGBPQ9NV56 204 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 FAM118AQ9NWS6 357 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 TAS2R1Q9NYW7 299 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 PEMTQ9UBM1 199 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 SLC23A1Q9UHI7 598 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 V9GYS6 101 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 IZUMO1RA6ND01 250 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 DHRS7CA6NNS2 312 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 GMNNO75496 209 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 IGLV3-1P01715 115 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 OCM2P0CE71 109 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 HTR1FP30939 366 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 RIDAP52758 137 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 ATP1B3P54709 279 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 RPS7P62081 194 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 LIPEQ05469 1076 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM177Q53S58 311 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 BCL2L15Q5TBC7 163 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 LIN54Q6MZP7 749 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 DEGS2Q6QHC5 323 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 SLC16A13Q7RTY0 426 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 RFESDQ8TAC1 157 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 MCUR1Q96AQ8 359 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 COQ2Q96H96 371 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 HMG20AQ9NP66 347 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 IL20Q9NYY1 176 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 IKZF2Q9UKS7 526 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 ANKRD34BA5PLL1 514 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 HSPB6O14558 160 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 DEGS1O15121 323 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF254O75437 659 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 TTRP02766 147 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 TRGV3P03979 118 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 RRM2P31350 389 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 RBP2P50120 134 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF45Q02386 682 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 PLGLAQ15195 96 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 MOGAT2Q3SYC2 334 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 ACTBL2Q562R1 376 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 HDXQ7Z353 690 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF575Q86XF7 245 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 WFDC3Q8IUB2 231 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM104Q8NE00 496 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 OR8D4Q8NGM9 314 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 OR13A1Q8NGR1 328 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 OR14K1Q8NGZ2 314 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 MRGPRDQ8TDS7 321 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 C2CD4CQ8TF44 421 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 RHOVQ96L33 236 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 MFFQ9GZY8 342 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 CMC2Q9NRP2 79 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 FBXL17Q9UF56 701 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 KIF25Q9UIL4 384 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 A0A0G2JLM5 398 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 NBR2O15453 112 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 ATP8B1O43520 1251 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 SPRY2O43597 315 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 SOX15O60248 233 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 SOX14O95416 240 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 NCK1P16333 377 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 ACTR3P61158 418 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 LRRC36Q1X8D7 754 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 RPEL1Q2QD12 228 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 DYDC1Q8WWB3 177 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 STON2Q8WXE9 905 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 ANKRD60Q9BZ19 345 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD3-211ENST00000559460 COMMD4Q9H0A8 199 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52 ms