RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 RAB11BQ15907 218 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 PIGYQ3MUY2 71 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 Q6P435 159 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 Q6ZTK2 550 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 GPR141Q7Z602 305 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 PNKDQ8N490 385 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 ST8SIA4Q92187 359 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 FAM234AQ9H0X4 552 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 PPA2Q9H2U2 334 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 ST3GAL6Q9Y274 331 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 AIPO00170 330 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 OR2H2O95918 312 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 TK1P04183 234 aa11.22□□□□□ -0.61
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CS-231ENST00000552222 PAX6P26367 422 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 LSM3P62310 102 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
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CS-231ENST00000552222 P2RY14Q15391 338 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 GPR107Q5VW38 600 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 CD276Q5ZPR3 534 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 LDLRAD3Q86YD5 345 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 CHST4Q8NCG5 386 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 TMEM185AQ8NFB2 350 aa11.22□□□□□ -0.61
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CS-231ENST00000552222 WDFY2Q96P53 400 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 CST11Q9H112 138 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 BANF2Q9H503 90 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 IFT22Q9H7X7 185 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 STEAP1Q9UHE8 339 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 TMEM82A0PJX8 343 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 SMIM30A4D0T7 59 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 NOTOA8MTQ0 251 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 TMEM14DPA8MWL7 114 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 DEGS1O15121 323 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 PSPNO60542 156 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 GABARAPO95166 117 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 ECDO95905 644 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 VSIG10L2P0DP72 767 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 ARSBP15848 533 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 NDUFB7P17568 137 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 GABRR1P24046 479 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 TGFBR1P36897 503 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 RANBP1P43487 201 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 CLDN12P56749 244 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 RPL15P61313 204 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
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CS-231ENST00000552222 CTF1Q16619 201 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 HES5Q5TA89 166 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 OR10K2Q6IF99 312 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 BTN2A1Q7KYR7 527 aa11.21□□□□□ -0.61
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CS-231ENST00000552222 OR8H2Q8N162 312 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 KLHDC1Q8N7A1 406 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 OR51D1Q8NGF3 324 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 OR5D13Q8NGL4 314 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 KCNG3Q8TAE7 436 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 FAM46BQ96A09 425 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 FAM3DQ96BQ1 224 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 Q96M66 194 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 DCTN5Q9BTE1 182 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 SIRPDQ9H106 197 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 ZNF581Q9P0T4 197 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 FBLN5Q9UBX5 448 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
CS-231ENST00000552222 TRAV24A0A0B4J272 114 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-231ENST00000552222 FAM90A10PA6NDY2 464 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-231ENST00000552222 FAM90A18PA6NE21 464 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-231ENST00000552222 FAM90A16PA6NEW6 464 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-231ENST00000552222 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-231ENST00000552222 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-231ENST00000552222 FAM90A7PA6NKC0 464 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-231ENST00000552222 FAM90A22PA8MWA6 464 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-231ENST00000552222 FAM90A12PA8MX19 464 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-231ENST00000552222 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-231ENST00000552222 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-231ENST00000552222 SIRPB1O00241 398 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-231ENST00000552222 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
CS-231ENST00000552222 LDLRAD4O15165 306 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-231ENST00000552222 FAM90A15PP0C7V4 464 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-231ENST00000552222 FAM90A13PP0C7W8 464 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-231ENST00000552222 FAM90A14PP0C7W9 464 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-231ENST00000552222 FAM90A24PP0C7X0 464 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-231ENST00000552222 CD28P10747 220 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-231ENST00000552222 ZNF44P15621 663 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-231ENST00000552222 OR3A1P47881 315 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-231ENST00000552222 VBP1P61758 197 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-231ENST00000552222 NCS1P62166 190 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-231ENST00000552222 MXD1Q05195 221 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-231ENST00000552222 UNC119Q13432 240 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-231ENST00000552222 MPV17LQ2QL34 196 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-231ENST00000552222 C2orf76Q3KRA6 126 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-231ENST00000552222 SFXN4Q6P4A7 337 aa11.2□□□□□ -0.62
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