RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548557.1

CASC18-202, Transcript of cancer susceptibility 18, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CASC18, Length 2,503 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC18-202ENST00000548557 NRN1LQ496H8 165 aa5.66□□□□□ -1.5
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CASC18-202ENST00000548557 FBXW9Q5XUX1 488 aa5.66□□□□□ -1.5
CASC18-202ENST00000548557 OR10K2Q6IF99 312 aa5.66□□□□□ -1.5
CASC18-202ENST00000548557 ALKAL2Q6UX46 152 aa5.66□□□□□ -1.5
CASC18-202ENST00000548557 GSG1LQ6UXU4 331 aa5.66□□□□□ -1.5
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CASC18-202ENST00000548557 STARD4Q96DR4 205 aa5.65□□□□□ -1.51
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CASC18-202ENST00000548557 QRFPP83859 136 aa5.64□□□□□ -1.51
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CASC18-202ENST00000548557 CEACAM16Q2WEN9 425 aa5.64□□□□□ -1.51
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