RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 FRRS1LQ9P0K9 344 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 VSIG4Q9Y279 399 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 RAB19A4D1S5 217 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM229AB2RXF0 380 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 H7BYZ3 331 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 G6PCP35575 357 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 ARF6P62330 175 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 CEACAM21Q3KPI0 293 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 FAM209AQ5JX71 171 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 OR8D4Q8NGM9 314 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 TMED6Q8WW62 240 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 OR4C12Q96R67 309 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 CTDSP1Q9GZU7 261 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 RAB18Q9NP72 206 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 RAB29O14966 203 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 TCAPO15273 167 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 SYNGR3O43761 229 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 PGA4P0DJD7 388 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 CD200P41217 278 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 TBR1Q16650 682 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 DUX5Q96PT3 197 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 NTN4Q9HB63 628 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 KPTNQ9Y664 436 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 SNRPGP15A8MWD9 76 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 TO15178 435 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 PTHLHP12272 177 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 AMTP48728 403 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 FAM27BQ5VT28 67 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 GCSAMQ8N6F7 178 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 NHLRC2Q8NBF2 726 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 OR8G5Q8NG78 346 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 GPR137Q96N19 417 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 TUBA4BQ9H853 241 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 CRHP06850 196 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 FAM27E3Q08E93 113 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 SMIM4Q8WVI0 70 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 ADIPOR1Q96A54 375 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 CHST1O43916 411 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 FUCA1P04066 466 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 GABRB1P18505 474 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 NTF3P20783 257 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 RPL30P62888 115 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 PLAURQ03405 335 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 TPRX1Q8N7U7 411 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 OXA1LQ15070 435 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 FAM219AQ8IW50 185 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 OR8I2Q8N0Y5 310 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 GAPTQ8N292 157 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 RNF133Q8WVZ7 376 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 CXorf58Q96LI9 332 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF385DQ9H6B1 395 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 PPP5D1E7EU14 171 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 OR2C1O95371 312 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 MGPP08493 103 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 ERGP11308 486 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 GGNBP1Q5YKI7 109 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 NCR3LG1Q68D85 454 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 GVQW1Q8N7I0 195 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 SLC24A4Q8NFF2 622 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 SLC26A10Q8NG04 563 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 OR4A4PQ8NGN8 299 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 DUSP21Q9H596 190 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 LOC285556D6RIA3 1793 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 SOCS1O15524 211 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 C10orf113Q5VZT2 155 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF826PQ6ZT77 177 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 OR1L8Q8NGR8 309 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 CHST5Q9GZS9 411 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 MGST3O14880 152 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 GNG4P50150 75 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 CFHR1Q03591 330 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 ATP5G2Q06055 141 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 VWA1Q6PCB0 445 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 G3V3Q6 166 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 GALR1P47211 349 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 BSPH1Q075Z2 132 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 FA2HQ7L5A8 372 aa8.22□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms