RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRT84Q9NSB2 600 aa7.66□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARMC1Q9NVT9 282 aa7.66□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FBXL17Q9UF56 701 aa7.66□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC23A1Q9UHI7 598 aa7.66□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIF25Q9UIL4 384 aa7.66□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LAMP5Q9UJQ1 280 aa7.66□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SELENOKQ9Y6D0 94 aa7.66□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 V9GYS6 101 aa7.66□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LRP1BQ9NZR2 4599 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACOD1A6NK06 481 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RTL8CO15255 209 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MITFO75030 526 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CYB5AP00167 134 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IL1AP01583 271 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CGB3P0DN86 165 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CGB7P0DN87 165 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZP3P21754 424 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SMIM11AP58511 58 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NDPQ00604 133 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF45Q02386 682 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPIN3Q5JUX0 258 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RDH10Q8IZV5 341 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR9Q2Q8NGE9 314 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UBALD1Q8TB05 177 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BORCS8Q96FH0 119 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RHOVQ96L33 236 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GGTLC1Q9BX51 225 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MROQ9BYG7 248 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HMG20AQ9NP66 347 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GID8Q9NWU2 228 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IL20Q9NYY1 176 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ERGIC3Q9Y282 383 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF785A8K8V0 405 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPRY2O43597 315 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NPPAP01160 153 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HLA-DRB1P01911 266 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ALOX5APP20292 161 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RRM2P31350 389 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FUT6P51993 359 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DEFB135Q30KP9 77 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LIN54Q6MZP7 749 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF645Q8N7E2 425 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DNAAF1Q8NEP3 725 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR2T33Q8NG76 320 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RFT1Q96AA3 541 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IKZF2Q9UKS7 526 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A1B0GTI1 187 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRR32B1ATL7 298 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DEGS1O15121 323 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GASTP01350 101 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRGV3P03979 118 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IFNA4P05014 189 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGHV3-43DP0DP04 118 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BMI1P35226 326 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACTBP60709 375 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 APOFQ13790 326 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACTBL2Q562R1 376 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BCL2L15Q5TBC7 163 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IQCF1Q8N6M8 205 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TCEANCQ8N8B7 351 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BTBD10Q9BSF8 475 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DGCR6LQ9BY27 220 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SCRT2Q9NQ03 307 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A0G2JND7 137 aa7.62□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa7.62□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MSGN1A6NI15 193 aa7.62□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGLL5B9A064 214 aa7.62□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa7.62□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa7.62□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC31A2O15432 143 aa7.62□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CSN2P05814 226 aa7.62□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IL3RAP26951 378 aa7.62□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CD40LGP29965 261 aa7.62□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RIDAP52758 137 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MTCP1P56278 107 aa7.62□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPS7P62081 194 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP7.62□□□□□ -1.192e-6■■■□□ 18.6
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