RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533817.5

TSTA3-216, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 3

Gene TSTA3, Length 871 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-216ENST00000533817 IFITM5A6NNB3 132 aa12.09□□□□□ -0.47
TSTA3-216ENST00000533817 LDLRAD4O15165 306 aa12.09□□□□□ -0.47
TSTA3-216ENST00000533817 PDCD6O75340 191 aa12.09□□□□□ -0.47
TSTA3-216ENST00000533817 GLAP06280 429 aa12.09□□□□□ -0.47
TSTA3-216ENST00000533817 FUT3P21217 361 aa12.09□□□□□ -0.47
TSTA3-216ENST00000533817 COX7A1P24310 79 aa12.09□□□□□ -0.47
TSTA3-216ENST00000533817 SAA4P35542 130 aa12.09□□□□□ -0.47
TSTA3-216ENST00000533817 GDNFP39905 211 aa12.09□□□□□ -0.47
TSTA3-216ENST00000533817 C17orf58Q2M2W7 97 aa12.09□□□□□ -0.47
TSTA3-216ENST00000533817 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa12.09□□□□□ -0.47
TSTA3-216ENST00000533817 HEPN1Q6WQI6 88 aa12.09□□□□□ -0.47
TSTA3-216ENST00000533817 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
TSTA3-216ENST00000533817 ZNF497Q6ZNH5 498 aa12.09□□□□□ -0.47
TSTA3-216ENST00000533817 FAM3DQ96BQ1 224 aa12.09□□□□□ -0.47
TSTA3-216ENST00000533817 AJUBAQ96IF1 538 aa12.09□□□□□ -0.47
TSTA3-216ENST00000533817 JMJD8Q96S16 334 aa12.09□□□□□ -0.47
TSTA3-216ENST00000533817 NICN1Q9BSH3 213 aa12.09□□□□□ -0.47
TSTA3-216ENST00000533817 LPAR5Q9H1C0 372 aa12.09□□□□□ -0.47
TSTA3-216ENST00000533817 RNF167Q9H6Y7 350 aa12.09□□□□□ -0.47
TSTA3-216ENST00000533817 FBLN5Q9UBX5 448 aa12.09□□□□□ -0.47
TSTA3-216ENST00000533817 PEX16Q9Y5Y5 336 aa12.09□□□□□ -0.47
TSTA3-216ENST00000533817 SESN1Q9Y6P5 492 aa12.09□□□□□ -0.47
TSTA3-216ENST00000533817 A0A0A6YYD4 124 aa12.08□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa12.08□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa12.08□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 SMIM30A4D0T7 59 aa12.08□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa12.08□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 ODF3BA8MYP8 253 aa12.08□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 MCRIP1C9JLW8 97 aa12.08□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 CHATP28329 748 aa12.08□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 GLP1RP43220 463 aa12.08□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 BAMBIQ13145 260 aa12.08□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 C2orf76Q3KRA6 126 aa12.08□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 MIDNQ504T8 468 aa12.08□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa12.08□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa12.08□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 Q6YL49 198 aa12.08□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 TPRA1Q86W33 373 aa12.08□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 GAPTQ8N292 157 aa12.08□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 OR11H6Q8NGC7 330 aa12.08□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 KCTD7Q96MP8 289 aa12.08□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 MDFIQ99750 246 aa12.08□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 CENPOQ9BU64 300 aa12.08□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 TMEM133Q9H2Q1 129 aa12.08□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 LINC00574Q9H8X3 128 aa12.08□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 CALYQ9NYX4 217 aa12.08□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 TRAV39A0A0B4J263 110 aa12.07□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa12.07□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa12.07□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 MEIOCA2RUB1 952 aa12.07□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 H3BUI4 141 aa12.07□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 AIPO00170 330 aa12.07□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 MT-ND4P03905 459 aa12.07□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 MELTFP08582 738 aa12.07□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 OMGP23515 440 aa12.07□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 CDK2P24941 298 aa12.07□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 SDC2P34741 201 aa12.07□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 RANBP1P43487 201 aa12.07□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 UBA52P62987 128 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 PLA2G7Q13093 441 aa12.07□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 SLC9A3R2Q15599 337 aa12.07□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 ZNF626Q68DY1 528 aa12.07□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa12.07□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 LDLRAD3Q86YD5 345 aa12.07□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 FAM89BQ8N5H3 189 aa12.07□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 ZNF565Q8N9K5 539 aa12.07□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 OR13D1Q8NGV5 346 aa12.07□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 MRGPRDQ8TDS7 321 aa12.07□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 NEK7Q8TDX7 302 aa12.07□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 ZFAND2BQ8WV99 257 aa12.07□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 C17orf50Q8WW18 174 aa12.07□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 DYRK2Q92630 601 aa12.07□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 ETAA1Q9NY74 926 aa12.07□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa12.06□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 A0A0B4J203 849 aa12.06□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 UBE2QL1A1L167 161 aa12.06□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 NOTOA8MTQ0 251 aa12.06□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa12.06□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 CLDN34H7C241 214 aa12.06□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 SOCS1O15524 211 aa12.06□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 IL1AP01583 271 aa12.06□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 FBP1P09467 338 aa12.06□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 CLEC2LP0C7M8 214 aa12.06□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 SSTR5P35346 364 aa12.06□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa12.06□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 NKAPLQ5M9Q1 402 aa12.06□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 RTN4RL2Q86UN3 420 aa12.06□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 OR13F1Q8NGS4 319 aa12.06□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 TMEM158Q8WZ71 300 aa12.06□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 ZDHHC16Q969W1 377 aa12.06□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 KIRREL1Q96J84 757 aa12.06□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 DUX5Q96PT3 197 aa12.06□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 NEDD4LQ96PU5 975 aa12.06□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 SULT4A1Q9BR01 284 aa12.06□□□□□ -0.48
TSTA3-216ENST00000533817 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms