RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504971.1

FBXO38-208, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-208	ENST00000504971	PRRG2	O14669	202 aa		5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	FGF17	O60258	216 aa		5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	ALOX12B	O75342	701 aa		5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF682	O95780	498 aa		5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	CLIC3	O95833	236 aa		5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	CBX7	O95931	251 aa		5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	MT-CO3	P00414	261 aa		5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	KNG1	P01042	644 aa		5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	C1QTNF9	P0C862	333 aa		5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	OR5H8	P0DN80	308 aa		5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	ARSB	P15848	533 aa		5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	HMGA2	P52926	109 aa		5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	AQP4	P55087	323 aa		5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	GABRA6	Q16445	453 aa		5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	GUSBP11	Q6P575	273 aa		5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	TMUB2	Q71RG4	321 aa		5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	EID2	Q8N6I1	236 aa		5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	OR2T29	Q8NH02	315 aa		5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	MAL2	Q969L2	176 aa		5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	S100A13	Q99584	98 aa		5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	STARD5	Q9NSY2	213 aa		5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	C1RL	Q9NZP8	487 aa		5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	JKAMP	Q9P055	326 aa		5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	RAB22A	Q9UL26	194 aa		5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	ADAMTS20	P59510	1910 aa		5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	PI4KA	P42356	2102 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A1B0GX78	115 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	LRP5L	A4QPB2	252 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF860	A6NHJ4	632 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	PATE3	B3GLJ2	98 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	PDCD5	O14737	125 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	CCL25	O15444	150 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	SYNGR1	O43759	233 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	GCG	P01275	180 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	GAST	P01350	101 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	HPX	P02790	462 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	MT-ND4L	P03901	98 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	OPN1SW	P03999	348 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	ADORA3	P0DMS8	318 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	OR12D1	P0DN82	309 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	MAOA	P21397	527 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	BRS3	P32247	399 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	APLNR	P35414	380 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	OR10A3	P58181	314 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	ARG2	P78540	354 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	PLA2G7	Q13093	441 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	PEA15	Q15121	130 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	OPN5	Q6U736	354 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	OAF	Q86UD1	273 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971		Q8N1Y9	231 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	POC1A	Q8NBT0	407 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	OR1L3	Q8NH93	324 aa		5.8	□□□□□ -1.48

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