RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 QRFPP83859 136 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 P2RY14Q15391 338 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF497Q6ZNH5 498 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM86BQ8N661 226 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 OR13F1Q8NGS4 319 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM158Q8WZ71 300 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 TNFRSF14Q92956 283 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 PHF21AQ96BD5 680 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 COQ2Q96H96 371 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 DPAGT1Q9H3H5 408 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 LIN7BQ9HAP6 207 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 KIF25Q9UIL4 384 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 HSF4Q9ULV5 492 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 BTBD17A6NE02 478 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 CCL3L1P16619 93 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 SDC2P34741 201 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 GLP1RP43220 463 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 ARHGDIBP52566 201 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 DLX6P56179 175 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 HES5Q5TA89 166 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 GPR141Q7Z602 305 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM89BQ8N5H3 189 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 TPRX1Q8N7U7 411 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF596Q8TC21 504 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 GFI1Q99684 422 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC6A7Q99884 636 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM133Q9H2Q1 129 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 PRDM13Q9H4Q3 707 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 LINC00574Q9H8X3 128 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 POMT1Q9Y6A1 747 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 ZFHX3Q15911 3703 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 CLDN34H7C241 214 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 SPINT2O43291 252 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 IL1AP01583 271 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 MT-ND4P03905 459 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 CDK2P24941 298 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 CHATP28329 748 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 CEACAM3P40198 252 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 UNC119Q13432 240 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 Q3ZCU0 254 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 NKAPLQ5M9Q1 402 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 MINOS1Q5TGZ0 78 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 SFXN4Q6P4A7 337 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 Q6ZTK2 550 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 MOB1BQ7L9L4 216 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 C11orf42Q8N5U0 333 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 OR11H6Q8NGC7 330 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 OR52M1Q8NGK5 317 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 CLEC7AQ9BXN2 247 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 LPAR5Q9H1C0 372 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 ING3Q9NXR8 418 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 CALYQ9NYX4 217 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 ABRACLQ9P1F3 81 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 ETV7Q9Y603 341 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3BP2-208ENST00000504294 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 MEIOCA2RUB1 952 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 TOR1AO14656 332 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 OR10A3P58181 314 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 BAMBIQ13145 260 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 AANATQ16613 207 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 TUSC1Q2TAM9 212 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 OR10K2Q6IF99 312 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 BRD3OSQ6XYD6 125 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 GAPTQ8N292 157 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 PNKDQ8N490 385 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 DTX3Q8N9I9 347 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 SSMEM1Q8WWF3 244 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 MALSU1Q96EH3 234 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 FUNDC2Q9BWH2 189 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 DAPK2Q9UIK4 370 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 SCOCQ9UIL1 159 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A087X0M5 115 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A0A6YYH2 397 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A1B0GX30 115 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 SHISA3A0PJX4 238 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 A6NJ64 397 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 SERPINE3A8MV23 424 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 LDLRAD4O15165 306 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 NOL3O60936 208 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 ARG1P05089 322 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 SMIM18P0DKX4 95 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 CD34P28906 385 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 RPL5P46777 297 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 VEGFCP49767 419 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 CLDN12P56749 244 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 RPL15P61313 204 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 MXD1Q05195 221 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms