RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 TMEM211Q6ICI0 200 aa11.01□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 MOB3AQ96BX8 217 aa11.01□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 WDYHV1Q96HA8 205 aa11.01□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 TECTBQ96PL2 329 aa11.01□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 FBXL17Q9UF56 701 aa11.01□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 IGHV2-70P01814 119 aa11□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 MBPP02686 304 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 TMEM33P57088 247 aa11□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 ARG2P78540 354 aa11□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 PLP2Q04941 152 aa11□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 C17orf78Q8N4C9 275 aa11□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 PRRX2Q99811 253 aa11□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 TUBD1Q9UJT1 453 aa11□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 CACNA1DQ01668 2161 aa11□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 DEDDO75618 318 aa11□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 C1QL1O75973 258 aa11□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 SMIM6P0DI80 62 aa11□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 CD46P15529 392 aa11□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 ARR3P36575 388 aa11□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 AWAT1Q58HT5 328 aa11□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 ZNF766Q5HY98 468 aa11□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 FAM76BQ5HYJ3 339 aa11□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 OR2T2Q6IF00 324 aa11□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 OR52M1Q8NGK5 317 aa11□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 TP53RKQ96S44 253 aa11□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 TAAR5O14804 337 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 NKX2-8O15522 239 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 CST4P01036 141 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 PPYP01298 95 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 COX5BP10606 129 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 GLP1RP43220 463 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 FGF12P61328 243 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 HERV-K104P61576 105 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 LIAT1Q6ZQX7 453 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 Q6ZRG5 221 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 MDP1Q86V88 176 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 Q8NFD4 153 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 NEK7Q8TDX7 302 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 ERGIC1Q969X5 290 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 TRAPPC2LH3BP13 241 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 CELA3BP08861 270 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 OR1K1Q8NGR3 316 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 GALNT14Q96FL9 552 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 PFDN5Q99471 154 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 RNF122Q9H9V4 155 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 MGAQ8IWI9 3026 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 SLC22A20A6NK97 555 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 UBE2CO00762 179 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 HS3ST1O14792 307 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 CA6P23280 308 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 GNRHRP30968 328 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 CLN3Q13286 438 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 OR2B11Q5JQS5 317 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 C20orf204Q6ZNR8 217 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 C18orf12Q96KH6 178 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 CEP250Q9BV73 2442 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 RHBDL1O75783 438 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 APLNRP35414 380 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 SULT1A2P50226 295 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 CEBPGP53567 150 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 HERPUD1Q15011 391 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 MKXQ8IYA7 352 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 OR5P3Q8WZ94 311 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 RDH5Q92781 318 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 OR51M1Q9H341 326 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 Q9N2K0 584 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 SMCO4Q9NRQ5 59 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 CACNA1GO43497 2377 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 JTBO76095 146 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 IGKV1-13P0DP09 117 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 SPIN3Q5JUX0 258 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 FBXW9Q5XUX1 488 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 GCNT2Q8N0V5 402 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 KIRREL1Q96J84 757 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 RFNGQ9Y644 331 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 ZNF292O60281 2723 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 TRAV39A0A0B4J263 110 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 A0A1B0GV90 55 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 H7C1Q1 480 aa10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms