RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491952.1

TTC3-222, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 5

Gene TTC3, Length 247 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-222	ENST00000491952	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		0.22	□□□□□ -2.37
TTC3-222	ENST00000491952	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		0.21	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	NRCAM	Q92823	1304 aa		0.21	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	WRB	O00258	174 aa		0.21	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	IGKV5-2	P06315	115 aa		0.21	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	TUBG1	P23258	451 aa		0.21	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	0.21	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	RAB25	P57735	213 aa		0.21	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	C2orf80	Q0P641	193 aa		0.21	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		0.21	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		0.21	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	ULK3	Q6PHR2	472 aa		0.21	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		0.21	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		0.21	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		0.21	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		0.21	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	CLDN23	Q96B33	292 aa		0.21	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	BEX2	Q9BXY8	128 aa		0.21	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		0.21	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		0.21	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		0.21	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		0.2	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		0.2	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	PGP	A6NDG6	321 aa		0.2	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		0.2	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	TOR1A	O14656	332 aa		0.2	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	ZBTB6	Q15916	424 aa		0.2	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	ATP6V1F	Q16864	119 aa		0.2	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		0.2	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	DUPD1	Q68J44	220 aa		0.2	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		0.2	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	PECR	Q9BY49	303 aa		0.2	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		0.2	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		0.2	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		0.2	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		0.19	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		0.19	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		0.19	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952		A0A1W2PRF3	423 aa		0.19	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952		A0A1W2PRM7	423 aa		0.19	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	CENPX	A8MT69	81 aa		0.19	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	TCF21	O43680	179 aa		0.19	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	KRT34	O76011	436 aa		0.19	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF3	P17036	446 aa		0.19	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	PRKACA	P17612	351 aa		0.19	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	GPR4	P46093	362 aa		0.19	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	DEFA6	Q01524	100 aa		0.19	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	SKP2	Q13309	424 aa		0.19	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	IL18	Q14116	193 aa		0.19	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	HES3	Q5TGS1	186 aa		0.19	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		0.19	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		0.19	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	GATD1	Q8NB37	220 aa		0.19	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	SUN5	Q8TC36	379 aa		0.19	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		0.19	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	CERS2	Q96G23	380 aa		0.19	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		0.19	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		0.19	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	0.19	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	PLCH2	O75038	1416 aa		0.19	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		0.18	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	TVP23A	A6NH52	213 aa		0.18	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		0.18	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952		J3QLI3	93 aa		0.18	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	OR4A8	P0C604	315 aa		0.18	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	IVD	P26440	423 aa		0.18	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	CSK	P41240	450 aa		0.18	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	LPAR6	P43657	344 aa		0.18	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	TAS2R60	P59551	318 aa		0.18	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	0.18	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	TAL2	Q16559	108 aa		0.18	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		0.18	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		0.18	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		0.18	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		0.18	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		0.18	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	CA13	Q8N1Q1	262 aa		0.18	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		0.18	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	GPX8	Q8TED1	209 aa		0.18	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	C16orf78	Q8WTQ4	265 aa		0.18	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		0.18	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		0.18	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	EXO5	Q9H790	373 aa		0.18	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	POMP	Q9Y244	141 aa		0.18	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		0.18	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		0.18	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		0.18	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	ROS1	P08922	2347 aa		0.18	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	0.17	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	DHRS12	A0PJE2	317 aa		0.17	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		0.17	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		0.17	□□□□□ -2.38
TTC3-222	ENST00000491952		K7EN84	100 aa		0.17	□□□□□ -2.38

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