RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488576.5

FAM107B-222, Transcript of family with sequence similarity 107 member B, human

TSL 4

Gene FAM107B, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM107B-222	ENST00000488576	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	CDKL2	Q92772	493 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	CLDN23	Q96B33	292 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	CMBL	Q96DG6	245 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	REEP6	Q96HR9	211 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	RILP	Q96NA2	401 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	OPALIN	Q96PE5	141 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	LINC01587	Q99440	93 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	VAT1	Q99536	393 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	MND1	Q9BWT6	205 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	CST9L	Q9H4G1	147 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	EXO5	Q9H790	373 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	C8orf4	Q9NR00	106 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	DIABLO	Q9NR28	239 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	AHSP	Q9NZD4	102 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	POMP	Q9Y244	141 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	BTRC	Q9Y297	605 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	NCKAP5	O14513	1909 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	COL18A1	P39060	1754 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	CEP170	Q5SW79	1584 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	DHRS12	A0PJE2	317 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	OR2AT4	A6NND4	320 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	CCDC169	A6NNP5	214 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	C2orf74	A8MZ97	194 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576		C9J4A7	227 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576		E7EWF7	191 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576		M0R1B8	84 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	UBE2L6	O14933	153 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	UBD	O15205	165 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	CASC3	O15234	703 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	GMDS	O60547	372 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	ZMPSTE24	O75844	475 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	TRAPPC6A	O75865	159 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	MYO1D	O94832	1006 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	CDK14	O94921	469 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	VAPB	O95292	243 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	KLK1	P06870	262 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	SLC2A1	P11166	492 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	ANXA8	P13928	327 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	GABRA1	P14867	456 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	SLC25A16	P16260	332 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	AKR1C4	P17516	323 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	CNTFR	P26992	372 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	ALDH3A1	P30838	453 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	GTF2H1	P32780	548 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	RCVRN	P35243	200 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	ACTR1B	P42025	376 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	GABRA4	P48169	554 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	DNASE1L1	P49184	302 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	TTPA	P49638	278 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	SULT1A2	P50226	295 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	MLF1	P58340	268 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	RAB2A	P61019	212 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	HBG1	P69891	147 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	HBG2	P69892	147 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	SLC35A2	P78381	396 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	DEFA6	Q01524	100 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	GNA12	Q03113	381 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	RELA	Q04206	551 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	XRCC4	Q13426	336 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	HTR4	Q13639	388 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	APOF	Q13790	326 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	PDK2	Q15119	407 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	ZBTB6	Q15916	424 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	TAL2	Q16559	108 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	TPRXL	Q17RH7	258 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM107B-222	ENST00000488576	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		0.23	□□□□□ -2.37

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms