RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 OR51A2Q8NGJ7 313 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 OR56B4Q8NH76 319 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 LEAP2Q969E1 77 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 SLC29A1Q99808 456 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 TMEM138Q9NPI0 162 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 ST3GAL6Q9Y274 331 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 PSMB11A5LHX3 300 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 BAG2O95816 211 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 TMEM11P17152 192 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 MYL12AP19105 171 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 MED21Q13503 144 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 PIGYQ3MUY2 71 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa16.05■□□□□ 0.16
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ACTB-212ENST00000484841 TMEM106AQ96A25 262 aa16.05■□□□□ 0.16
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ACTB-212ENST00000484841 PSG11Q9UQ72 335 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 CDRT1O95170 752 aa16.04■□□□□ 0.16
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ACTB-212ENST00000484841 LIMS4P0CW20 117 aa16.04■□□□□ 0.16
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ACTB-212ENST00000484841 CGB7P0DN87 165 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 GZMHP20718 246 aa16.04■□□□□ 0.16
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ACTB-212ENST00000484841 DDI2Q5TDH0 399 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 ZNF529Q6P280 563 aa16.04■□□□□ 0.16
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ACTB-212ENST00000484841 DRAM1Q8N682 238 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 SUMF2Q8NBJ7 301 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 OR51D1Q8NGF3 324 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 NEK7Q8TDX7 302 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 CKLFQ9UBR5 152 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
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ACTB-212ENST00000484841 AMY2AP04746 511 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 SERPINA2P20848 420 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 BDKRB2P30411 391 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 PAX5Q02548 391 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 HNF4GQ14541 408 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 ATAD3CQ5T2N8 411 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 LINC00596Q86U02 117 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 OR52N1Q8NH53 320 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 DPF1Q92782 380 aa16.03■□□□□ 0.16
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ACTB-212ENST00000484841 UTF1Q5T230 341 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 OR2G6Q5TZ20 316 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 ASCL4Q6XD76 172 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 STX19Q8N4C7 294 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 Q8NFD4 153 aa16.02■□□□□ 0.16
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ACTB-212ENST00000484841 APH1BQ8WW43 257 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 RDH12Q96NR8 316 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 GPR61Q9BZJ8 451 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 LINC00574Q9H8X3 128 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 IL36GQ9NZH8 169 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 ZNF281Q9Y2X9 895 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 TRAV39A0A0B4J263 110 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 FAM90A18PA6NE21 464 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 FAM90A16PA6NEW6 464 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 SERPINE3A8MV23 424 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 FAM90A12PA8MX19 464 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa16.01■□□□□ 0.15
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ACTB-212ENST00000484841 IGKV1-33P01594 117 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
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ACTB-212ENST00000484841 FAM90A13PP0C7W8 464 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 FAM90A14PP0C7W9 464 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 FAM90A24PP0C7X0 464 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 IL3RAP26951 378 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 ETV1P50549 477 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 RBM11P57052 281 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 RIPK1Q13546 671 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 GPR176Q14439 515 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 C10orf99Q6UWK7 81 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 MOB3BQ86TA1 216 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 FOXRED2Q8IWF2 684 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 RAB9BQ9NP90 201 aa16.01■□□□□ 0.15
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