RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 H3BMQ9 156 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 CDIPTO14735 213 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 HS3ST1O14792 307 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 ANGPTL7O43827 346 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 NOL3O60936 208 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 RHBDL1O75783 438 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 GATBO75879 557 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 ARL6IP5O75915 188 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 GABARAPO95166 117 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 CST4P01036 141 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 CD8AP01732 235 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 IGHV1-46P01743 117 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 DANCRP0C864 163 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 RAB3AP20336 220 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 KITLGP21583 273 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 MYL9P24844 172 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 DNASE1P24855 282 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 BDKRB2P30411 391 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 PEX19P40855 299 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 POU3F4P49335 361 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 NPY4RP50391 375 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 TMBIM6P55061 237 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 SNU13P55769 128 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 MTCP1P56278 107 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 PPP3R1P63098 170 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 CCL8P80075 99 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 PLA2G7Q13093 441 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 MAB21L1Q13394 359 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 MADCAM1Q13477 382 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 OR8G1Q15617 311 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 MPPED2Q15777 294 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 IDNKQ5T6J7 187 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 DDI2Q5TDH0 399 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM42Q69YG0 159 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 OR10K2Q6IF99 312 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 Q6ZSR3 168 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 WDR86Q86TI4 376 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 CALHM1Q8IU99 346 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 JAGN1Q8N5M9 183 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 C19orf18Q8NEA5 215 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 OR5D14Q8NGL3 314 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 OR10K1Q8NGX5 313 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 OR13G1Q8NGZ3 307 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 OR8S1Q8NH09 359 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 RAB2BQ8WUD1 216 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 ITLN1Q8WWA0 313 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 HPSE2Q8WWQ2 592 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 OR5P3Q8WZ94 311 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 CYYR1Q96J86 154 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF488Q96MN9 340 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 OR2V2Q96R30 315 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 GPER1Q99527 375 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 GAL3ST1Q99999 423 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 CHST5Q9GZS9 411 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 FAM192AQ9GZU8 254 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF442Q9H7R0 627 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 DYNLRB1Q9NP97 96 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 DCAF16Q9NXF7 216 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 CKLFQ9UBR5 152 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 SLC7A11Q9UPY5 501 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 CACNG2Q9Y698 323 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 POMT1Q9Y6A1 747 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 DSCAMO60469 2012 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 CACNA1DQ01668 2161 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 LRRK2Q5S007 2527 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 CELSR2Q9HCU4 2923 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 AKAP6Q13023 2319 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa3.92□□□□□ -1.78
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PTPRC-211ENST00000484135 A0A1W2PS18 150 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 PQLC2LA1A4F0 135 aa3.92□□□□□ -1.78
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PTPRC-211ENST00000484135 F8VWA3 439 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 M0R233 179 aa3.92□□□□□ -1.78
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PTPRC-211ENST00000484135 AKR7A2O43488 359 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 SULT1B1O43704 296 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 SYNGR1O43759 233 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 PAHP00439 452 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 RAF1P04049 648 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 TFF1P04155 84 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 RAB3BP20337 219 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 TUBG1P23258 451 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 COL8A2P25067 703 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 PMELP40967 661 aa3.92□□□□□ -1.78
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