RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 CADM4Q8NFZ8 388 aa6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 OR5AU1Q8NGC0 362 aa6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 OR5H2Q8NGV7 314 aa6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 CMTM2Q8TAZ6 248 aa6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 ZNF519Q8TB69 540 aa6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 WDYHV1Q96HA8 205 aa6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 SPIN2AQ99865 258 aa6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 OR51I2Q9H344 312 aa6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 C20orf141Q9NUB4 165 aa6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 ZNF319Q9P2F9 582 aa6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 HHLA2Q9UM44 414 aa6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 SLC5A6Q9Y289 635 aa6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 LIPGQ9Y5X9 500 aa6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 F5P12259 2224 aa6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 COL6A3P12111 3177 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 COL4A3Q01955 1670 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 A0A0G2JN53 185 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 A0A1W2PRS3 328 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 ANKUB1A6NFN9 424 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 GAGE10A6NGK3 116 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 LIPT2A6NK58 231 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 TMEM14DPA8MWL7 114 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 ZNF814B7Z6K7 855 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 TNFSF14O43557 240 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 LDB3O75112 727 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 KLKB1P03952 638 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 PCCBP05166 539 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 CCNOP22674 350 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 CCKBRP32239 447 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 SOX2P48431 317 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 TAS2R30P59541 319 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 RPL15P61313 204 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 PAX2Q02962 417 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 DMWDQ09019 674 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 ADIPOQQ15848 244 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 ZNF77Q15935 545 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 RNF151Q2KHN1 245 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 SNAI3Q3KNW1 292 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 MFSD12Q6NUT3 480 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 WDR73Q6P4I2 378 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 PARM1Q6UWI2 310 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 TREML4Q6UXN2 200 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 ZNF440Q8IYI8 595 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 OR4N2Q8NGD1 307 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 OR4K13Q8NH42 304 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 PFN4Q8NHR9 129 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 KCNG3Q8TAE7 436 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 FGF14Q92915 247 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 ERGIC1Q969X5 290 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 ARRDC3Q96B67 414 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 ELSPBP1Q96BH3 223 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 REEP6Q96HR9 211 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 TAAR6Q96RI8 345 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 SDF2Q99470 211 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 TXNDC17Q9BRA2 123 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 C11orf1Q9H5F2 150 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 ZNF586Q9NXT0 402 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 CES1P1Q9UKY3 287 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 LAMP3Q9UQV4 416 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 CCL26Q9Y258 94 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 LRP12Q9Y561 859 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 EML5Q05BV3 1969 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 C5orf42Q9H799 3197 aa6.19□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 IGLC7A0M8Q6 106 aa6.19□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 VSTM2BA6NLU5 285 aa6.19□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 G3V4G9 280 aa6.19□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 HS3ST1O14792 307 aa6.19□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 TMPRSS11DO60235 418 aa6.19□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 STC2O76061 302 aa6.19□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 GYPBP06028 91 aa6.19□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 GLRA1P23415 457 aa6.19□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 ATP6V0CP27449 155 aa6.19□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 MDH2P40926 338 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 REG1BP48304 166 aa6.19□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 PRRX1P54821 245 aa6.19□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 SLC9A3R2Q15599 337 aa6.19□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 CBLN3Q6UW01 205 aa6.19□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 PLXDC2Q6UX71 529 aa6.19□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
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