RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462125.5

C9orf3-210, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-210ENST00000462125 GALP22466 123 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-210ENST00000462125 GABRA5P31644 462 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-210ENST00000462125 SOX6P35712 828 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-210ENST00000462125 RAB13P51153 203 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-210ENST00000462125 EFNB2P52799 333 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-210ENST00000462125 TAS2R43P59537 309 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-210ENST00000462125 SCN1BQ07699 218 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-210ENST00000462125 GPR50Q13585 617 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-210ENST00000462125 OR52W1Q6IF63 320 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-210ENST00000462125 RTN4RL2Q86UN3 420 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-210ENST00000462125 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-210ENST00000462125 GHSRQ92847 366 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-210ENST00000462125 BORCS5Q969J3 196 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM106AQ96A25 262 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-210ENST00000462125 COQ2Q96H96 371 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-210ENST00000462125 CLEC7AQ9BXN2 247 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-210ENST00000462125 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-210ENST00000462125 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-210ENST00000462125 TCF7L1Q9HCS4 588 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM138Q9NPI0 162 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-210ENST00000462125 TAS2R4Q9NYW5 299 aa10.66□□□□□ -0.7
C9orf3-210ENST00000462125 A0A087X0M5 115 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-210ENST00000462125 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-210ENST00000462125 A0A1B0GX30 115 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-210ENST00000462125 ODAMA1E959 279 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-210ENST00000462125 FAM90A22PA8MWA6 464 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-210ENST00000462125 CHST1O43916 411 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-210ENST00000462125 IGLV1-47P01700 117 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-210ENST00000462125 CDK2P24941 298 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-210ENST00000462125 HTR1DP28221 377 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-210ENST00000462125 CD34P28906 385 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-210ENST00000462125 PTGFRP43088 359 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-210ENST00000462125 VBP1P61758 197 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-210ENST00000462125 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-210ENST00000462125 PAX5Q02548 391 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-210ENST00000462125 IL13RA2Q14627 380 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-210ENST00000462125 FAM189A2Q15884 450 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-210ENST00000462125 KRBOX4Q5JUW0 171 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-210ENST00000462125 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-210ENST00000462125 Q8N2B8 174 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-210ENST00000462125 ABHD12Q8N2K0 398 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-210ENST00000462125 OR4P4Q8NGL7 312 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-210ENST00000462125 OR4C13Q8NGP0 309 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-210ENST00000462125 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-210ENST00000462125 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-210ENST00000462125 MMP27Q9H306 513 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-210ENST00000462125 PITPNC1Q9UKF7 332 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-210ENST00000462125 SIGLEC9Q9Y336 463 aa10.65□□□□□ -0.7
C9orf3-210ENST00000462125 TRAV24A0A0B4J272 114 aa10.64□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 NCS1P62166 190 aa10.64□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF846Q147U1 533 aa10.64□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 TRAM1Q15629 374 aa10.64□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 SSX1Q16384 188 aa10.64□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 C17orf58Q2M2W7 97 aa10.64□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 YIF1BQ5BJH7 314 aa10.64□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 NHLRC3Q5JS37 347 aa10.64□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa10.64□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF565Q8N9K5 539 aa10.64□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 OR2T6Q8NHC8 308 aa10.64□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 NDNFQ8TB73 568 aa10.64□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF596Q8TC21 504 aa10.64□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 CFHR4Q92496 578 aa10.64□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 PGLYRP3Q96LB9 341 aa10.64□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 GPER1Q99527 375 aa10.64□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa10.64□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 LINC00574Q9H8X3 128 aa10.64□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 ABCB10Q9NRK6 738 aa10.64□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 IL36GQ9NZH8 169 aa10.64□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 OR6C3Q9NZP0 311 aa10.64□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 DPM3Q9P2X0 92 aa10.64□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 HILPDAQ9Y5L2 63 aa10.64□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa10.63□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa10.63□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 CD1AP06126 327 aa10.63□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 BDKRB2P30411 391 aa10.63□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 GDNFP39905 211 aa10.63□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 KCNJ3P48549 501 aa10.63□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 LSM3P62310 102 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 PPP3R1P63098 170 aa10.63□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 HERPUD1Q15011 391 aa10.63□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 RSU1Q15404 277 aa10.63□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 Q499Y3 187 aa10.63□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 PLA1AQ53H76 456 aa10.63□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa10.63□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 BARHL1Q9BZE3 327 aa10.63□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 OR51E2Q9H255 320 aa10.63□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 IFT22Q9H7X7 185 aa10.63□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF702PQ9H963 129 aa10.63□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 SERTAD4Q9NUC0 356 aa10.63□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 VWFP04275 2813 aa10.63□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa10.62□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa10.62□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 LY6LH3BQJ8 138 aa10.62□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 CDRT1O95170 752 aa10.62□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 HTR3BO95264 441 aa10.62□□□□□ -0.71
C9orf3-210ENST00000462125 OR3A4PP47883 348 aa10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms