RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
ECHDC1-211ENST00000460558 ACTRT1Q8TDG2 376 aa2.97□□□□□ -1.93
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ECHDC1-211ENST00000460558 GGTLC1Q9BX51 225 aa2.97□□□□□ -1.93
ECHDC1-211ENST00000460558 NDEL1Q9GZM8 345 aa2.97□□□□□ -1.93
ECHDC1-211ENST00000460558 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
ECHDC1-211ENST00000460558 ABCG5Q9H222 651 aa2.97□□□□□ -1.93
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ECHDC1-211ENST00000460558 GPR173Q9NS66 373 aa2.97□□□□□ -1.93
ECHDC1-211ENST00000460558 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
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ECHDC1-211ENST00000460558 PYCARDQ9ULZ3 195 aa2.97□□□□□ -1.93
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ECHDC1-211ENST00000460558 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa2.96□□□□□ -1.94
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ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF621Q6ZSS3 439 aa2.96□□□□□ -1.94
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ECHDC1-211ENST00000460558 OR2AE1Q8NHA4 323 aa2.96□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 TWIST2Q8WVJ9 160 aa2.96□□□□□ -1.94
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ECHDC1-211ENST00000460558 ITFG2Q969R8 447 aa2.96□□□□□ -1.94
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ECHDC1-211ENST00000460558 KCTD7Q96MP8 289 aa2.96□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 PANX1Q96RD7 426 aa2.96□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 MICU1Q9BPX6 476 aa2.96□□□□□ -1.94
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ECHDC1-211ENST00000460558 SLC7A7Q9UM01 511 aa2.96□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 PIGLQ9Y2B2 252 aa2.96□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 SNX24Q9Y343 169 aa2.96□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa2.95□□□□□ -1.94
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ECHDC1-211ENST00000460558 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
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ECHDC1-211ENST00000460558 C5orf51A6NDU8 294 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM183AA6NL82 134 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 RFPL4AA6NLU0 287 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 C5orf58C9J3I9 102 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 M0R135 149 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 MPZL2O60487 215 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 OR5F1O95221 314 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 IGLV1-47P01700 117 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 APOHP02749 345 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 CD7P09564 240 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 FUT1P19526 365 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 ZP3P21754 424 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 S100A3P33764 101 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 PHBP35232 272 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 GPR4P46093 362 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 RAB9AP51151 201 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC7A2P52569 658 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 MFAP2P55001 183 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 EDDM3BP56851 147 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 HIST1H3AP68431 136 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 DEFB135Q30KP9 77 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 SMIM21Q3B7S5 101 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 KRT71Q3SY84 523 aa2.95□□□□□ -1.94
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