RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-204ENST00000424089 KITLGP21583 273 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 CA6P23280 308 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 OPRM1P35372 400 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 SERPINF1P36955 418 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 HERV-K104P61576 105 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 UBA52P62987 128 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 SRPXP78539 464 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 ABCA11PQ4W5N1 156 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 C1orf185Q5T7R7 199 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 VWA1Q6PCB0 445 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 SLC22A25Q6T423 547 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 LRTM2Q8N967 370 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 OR8G5Q8NG78 346 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 OR1J1Q8NGS3 322 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 SLC25A40Q8TBP6 338 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 SEC22AQ96IW7 307 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 C2orf50Q96LR7 162 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 FOXC2Q99958 501 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 SFXN3Q9BWM7 321 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 OR2J1Q9GZK6 312 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM100Q9NV29 134 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 AUP1Q9Y679 476 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 A0A1B0GW55 424 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 ANKRD34BA5PLL1 514 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 MSTNO14793 375 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 DEGS1O15121 323 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 SYNGR1O43759 233 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 DUX4L2P0CJ85 424 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 DUX4L3P0CJ86 424 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 DUX4L4P0CJ87 422 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 DUX4L5P0CJ88 424 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 DUX4L6P0CJ89 424 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 DUX4L7P0CJ90 424 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 LYL1P12980 280 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 PRKACAP17612 351 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 FCGR2CP31995 323 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 ERVK11-1P61568 191 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 SLC9A3R2Q15599 337 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF718Q3SXZ3 478 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 SPIN3Q5JUX0 258 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 TIMM23BQ5SRD1 257 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 MOB1BQ7L9L4 216 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 SSX8Q7RTT4 187 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 DOLPP1Q86YN1 238 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF610Q8N9Z0 462 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 BHLHE23Q8NDY6 225 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 FAM57AQ8TBR7 257 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 SCARB1Q8WTV0 552 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 NINJ1Q92982 152 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 PHYHIPLQ96FC7 376 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 DMRTA2Q96SC8 542 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 RSRP1Q9BUV0 290 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 WDR13Q9H1Z4 485 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 NAA60Q9H7X0 242 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 MED9Q9NWA0 146 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 CRIM1Q9NZV1 1036 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 DNAJB11Q9UBS4 358 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 DUX4Q9UBX2 424 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 GLS2Q9UI32 602 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 PCDHB10Q9UN67 800 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 SPEF1Q9Y4P9 236 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 ATP23Q9Y6H3 246 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 A0A1B0GWJ7 208 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 CCSO14618 274 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 SH2D1BO14796 132 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 BCL2L11O43521 198 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 KNG1P01042 644 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 CELA3BP08861 270 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 PGA5P0DJD9 388 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 FOSL1P15407 271 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 GCH1P30793 250 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 CHRNB4P30926 498 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 PIGPP57054 158 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 RND3P61587 244 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 FOXF2Q12947 444 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 PSG7Q13046 419 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 BAMBIQ13145 260 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 IL15RAQ13261 267 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF146Q15072 292 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 OR8G1Q15617 311 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 ANKRD55Q3KP44 614 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 SPATA46Q5T0L3 261 aa8.51□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms