RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR4D11Q8NGI4 311 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR1L8Q8NGR8 309 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCL4L1Q8NHW4 92 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 TEKT1Q969V4 418 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC39A13Q96H72 371 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR2A7Q96R45 310 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 TESK2Q96S53 571 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 FMO2Q99518 471 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 ACAT2Q9BWD1 397 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 CDCA4Q9BXL8 241 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 PLEKHA1Q9HB21 404 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 CD209Q9NNX6 404 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 PFDN4Q9NQP4 134 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 HEBP1Q9NRV9 189 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 BFARQ9NZS9 450 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC22A14Q9Y267 594 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 KNSTRNQ9Y448 316 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 KLF12Q9Y4X4 402 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 SNX5Q9Y5X3 404 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 DNAH9Q9NYC9 4486 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 METTL21EPA6NDL7 271 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR5K4A6NMS3 321 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 CLDN5O00501 218 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 CLDN3O15551 220 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 KLRC4O43908 158 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 FGGP02679 453 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 C1QBP02746 253 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 RLN2P04090 185 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 RALAP11233 206 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRTN3P24158 256 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 MYL9P24844 172 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 IVDP26440 423 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 GGT2P36268 569 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 SSR4P51571 173 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 EMP1P54849 157 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPATA4Q8NEY3 305 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR10T2Q8NGX3 314 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 C7orf34Q96L11 122 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 TBATAQ96M53 351 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCL19Q99731 98 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 ACBD6Q9BR61 282 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 TSGA10Q9BZW7 698 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 CLSTN2Q9H4D0 955 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 C11orf49Q9H6J7 331 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 FUT9Q9Y231 359 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 AP3M1Q9Y2T2 418 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCL27Q9Y4X3 112 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 LAMB1P07942 1786 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 MGAMO43451 1857 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC5A10A0PJK1 596 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 CPLX1O14810 134 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR1I1O60431 355 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 EEDO75530 441 aaKnown RBP-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 DIRAS1O95057 198 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 PSMG1O95456 288 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 KLK1P06870 262 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 CXCR1P25024 350 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 INCA1Q0VD86 236 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRNTQ86SH4 94 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 SAMD3Q8N6K7 520 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR2M3Q8NG83 312 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR1S1Q8NH92 325 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 KCTD4Q8WVF5 259 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM3CQ92520 227 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 GTF2H4Q92759 462 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 LRRC39Q96DD0 335 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 NRBF2Q96F24 287 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 PKNOX2Q96KN3 472 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR5B12Q96R08 314 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 VAT1Q99536 393 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLF1Q9BQI6 1058 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM117Q9H0C3 514 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARV1Q9H2C2 271 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 C11orf1Q9H5F2 150 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 VAT1LQ9HCJ6 419 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 WASHC3Q9Y3C0 194 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 CUX2O14529 1486 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 CNTNAP1P78357 1384 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 UNC13CQ8NB66 2214 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa-2.46□□□□□ -2.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms