RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 MPV17LQ2QL34 196 aa7.84□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 WDR31Q8NA23 367 aa7.84□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 COPS9Q8WXC6 57 aa7.84□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa7.84□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 HSF4Q9ULV5 492 aa7.84□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 SPRY3O43610 288 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 FCGR3BO75015 233 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 CT62P0C5K7 136 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 ZGLP1P0C6A0 271 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
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PTPRM-202ENST00000400053 OR1L3Q8NH93 324 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa7.83□□□□□ -1.16
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PTPRM-202ENST00000400053 OR10V1Q8NGI7 309 aa7.83□□□□□ -1.16
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PTPRM-202ENST00000400053 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 OR11H4Q8NGC9 324 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 RFESDQ8TAC1 157 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 RPS4Y2Q8TD47 263 aa7.83□□□□□ -1.16
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PTPRM-202ENST00000400053 ANXA10Q9UJ72 324 aa7.83□□□□□ -1.16
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PTPRM-202ENST00000400053 DHRS13Q6UX07 377 aa7.82□□□□□ -1.16
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PTPRM-202ENST00000400053 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
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PTPRM-202ENST00000400053 CARFQ8N187 725 aa7.82□□□□□ -1.16
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PTPRM-202ENST00000400053 GPBAR1Q8TDU6 330 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 Q8WTZ3 238 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 GLRX2Q9NS18 164 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 CES1P1Q9UKY3 287 aa7.82□□□□□ -1.16
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