RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 FBP1P09467 338 aa12.57□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 COX7A1P24310 79 aa12.57□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 CFPP27918 469 aa12.57□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 GLP1RP43220 463 aa12.57□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 KLRD1Q13241 179 aa12.57□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 DEFB112Q30KQ8 113 aa12.57□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 TCF23Q7RTU1 214 aa12.57□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 PNKDQ8N490 385 aa12.57□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 OR51D1Q8NGF3 324 aa12.57□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 TM2D1Q9BX74 207 aa12.57□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 OR51E2Q9H255 320 aa12.57□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 RAB9BQ9NP90 201 aa12.57□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 ETAA1Q9NY74 926 aa12.57□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A1W2PRD5 423 aa12.56□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A1W2PRF3 423 aa12.56□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A1W2PRM7 423 aa12.56□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 MEIOCA2RUB1 952 aa12.56□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 TRIM64CA6NLI5 447 aa12.56□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 NOTOA8MTQ0 251 aa12.56□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 AIPO00170 330 aa12.56□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 GADD45AP24522 165 aa12.56□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 CDK2P24941 298 aa12.56□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 SAA4P35542 130 aa12.56□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 QRFPP83859 136 aa12.56□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 C2orf76Q3KRA6 126 aa12.56□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 HES5Q5TA89 166 aa12.56□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 OR10K2Q6IF99 312 aa12.56□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 PIP4P2Q8N4L2 257 aa12.56□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa12.56□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM133Q9H2Q1 129 aa12.56□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF581Q9P0T4 197 aa12.56□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 RAB22AQ9UL26 194 aa12.56□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A0U1RQK1 487 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 CLDN34H7C241 214 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 MT-ND4P03905 459 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 DLX1P56177 255 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 CLDN12P56749 244 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 OR10A3P58181 314 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 UNC119Q13432 240 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 NKAPLQ5M9Q1 402 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 HCP5Q6MZN7 132 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 TRAT1Q6PIZ9 186 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 BRICD5Q6PL45 260 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 Q6YL49 198 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF497Q6ZNH5 498 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 RTN4RL2Q86UN3 420 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM86BQ8N661 226 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 OR11H6Q8NGC7 330 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 OR10A7Q8NGE5 316 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 SSMEM1Q8WWF3 244 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 DPAGT1Q9H3H5 408 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 CALYQ9NYX4 217 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 CUBNO60494 3623 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 SHISA3A0PJX4 238 aa12.54□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 BTBD17A6NE02 478 aa12.54□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 AIREO43918 545 aa12.54□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 IL1AP01583 271 aa12.54□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 ARG1P05089 322 aa12.54□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 CGB3P0DN86 165 aa12.54□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 CGB7P0DN87 165 aa12.54□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 C6orf183Q5T699 404 aa12.54□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa12.54□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 SIGIRRQ6IA17 410 aa12.54□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM89BQ8N5H3 189 aa12.54□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 ZDHHC22Q8N966 263 aa12.54□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 OR56B1Q8NGI3 324 aa12.54□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 OR13A1Q8NGR1 328 aa12.54□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 MRGPRDQ8TDS7 321 aa12.54□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM216AQ8WUB2 273 aa12.54□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 YIPF6Q96EC8 236 aa12.54□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 CLEC7AQ9BXN2 247 aa12.54□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 LPAR5Q9H1C0 372 aa12.54□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 LINC00574Q9H8X3 128 aa12.54□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa12.54□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 POMT1Q9Y6A1 747 aa12.54□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 SVEP1Q4LDE5 3571 aa12.54□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 STAB1Q9NY15 2570 aa12.54□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa12.53□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 UBE2QL1A1L167 161 aa12.53□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 METTL21EPA6NDL7 271 aa12.53□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa12.53□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 TOR1AO14656 332 aa12.53□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 ORC5O43913 435 aa12.53□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM127O75204 238 aa12.53□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 MELTFP08582 738 aa12.53□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 RAB6AP20340 208 aa12.53□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 CHATP28329 748 aa12.53□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 SDC2P34741 201 aa12.53□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 PRRX1P54821 245 aa12.53□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 UBA52P62987 128 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC9A3R2Q15599 337 aa12.53□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF626Q68DY1 528 aa12.53□□□□□ -0.4
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