RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281821.6

EPHA4-201, Transcript of EPH receptor A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EPHA4, Length 6,346 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA4-201ENST00000281821 TM2D1Q9BX74 207 aa6.64□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 SHARPINQ9H0F6 387 aa6.64□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 TMED3Q9Y3Q3 217 aa6.64□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 DPRXA6NFQ7 191 aa6.64□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 J3QLI3 93 aa6.64□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 CNIH1O95406 144 aa6.64□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 IL5P05113 134 aa6.64□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 MPZP25189 248 aa6.64□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 OR3A4PP47883 348 aa6.64□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 LGALS7P47929 136 aa6.64□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 PLAURQ03405 335 aa6.64□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 Q6ZNX1 250 aa6.64□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 A0A0B4J2A0 478 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 TMEM14DPA8MWL7 114 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 ST8SIA3O43173 380 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 CGAP01215 116 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 IFNA1P01562 189 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 HTR1DP28221 377 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 OR3A1P47881 315 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 RPS16P62249 146 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 ZNF154Q13106 437 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 TMEM128Q5BJH2 165 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 FAM76BQ5HYJ3 339 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 TMEM91Q6ZNR0 172 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 Q8NA96 180 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 Q96M66 194 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 SOX7Q9BT81 388 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 SHPKQ9UHJ6 478 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 IFNA17P01571 189 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 FAM106CPP0CH98 169 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 USF1P22415 310 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 VAX1Q5SQQ9 334 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 SUMF2Q8NBJ7 301 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 NPAP1Q9NZP6 1156 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 GSKIPQ9P0R6 139 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 RAB29O14966 203 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 ACP7Q6ZNF0 438 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 CLEC7AQ9BXN2 247 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 OR51J1Q9H342 316 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 CCDC88CQ9P219 2028 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 A1L4Q6 167 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 M0R036 132 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 OR52I2Q8NH67 350 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 ABHD1Q96SE0 405 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 GFOD1Q9NXC2 390 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 FZR1Q9UM11 496 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 OR2W1Q9Y3N9 320 aa6.63□□□□□ -1.35
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EPHA4-201ENST00000281821 C17orf112F2Z3M2 114 aa6.62□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 TCRBP04435 133 aa6.62□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 FGF2P09038 288 aa6.62□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 SLC35B1P78383 322 aa6.62□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 PHYHD1Q5SRE7 291 aa6.62□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 PCSK4Q6UW60 755 aa6.62□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa6.62□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 TAF9BQ9HBM6 251 aa6.62□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa6.62□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 SIGLEC5O15389 551 aa6.62□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 BCL3P20749 454 aa6.62□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 OMGP23515 440 aa6.62□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 CAV3P56539 151 aa6.62□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 ALKBH6Q3KRA9 238 aa6.62□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
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EPHA4-201ENST00000281821 OR51I2Q9H344 312 aa6.62□□□□□ -1.35
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EPHA4-201ENST00000281821 CRIM1Q9NZV1 1036 aa6.62□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 PRNDQ9UKY0 176 aa6.62□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa6.62□□□□□ -1.35
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EPHA4-201ENST00000281821 F12P00748 615 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 DUSP1P28562 367 aa6.62□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 RPL35P42766 123 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 SNAI3Q3KNW1 292 aa6.62□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 IQCF2Q8IXL9 164 aa6.62□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 LRRK1Q38SD2 2015 aa6.62□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 J3QRE1 110 aa6.62□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 LANCL1O43813 399 aa6.62□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 TATDN3Q17R31 274 aa6.62□□□□□ -1.35
EPHA4-201ENST00000281821 LILRB2Q8N423 598 aa6.62□□□□□ -1.35
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