RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637325.1

PNKP-228, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, human

TSL 5

Gene PNKP, Length 100 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNKP-228	ENST00000637325		M0QZ24	198 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	TOR1A	O14656	332 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	SERPINA2	P20848	420 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	HTR1D	P28221	377 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	TREML4	Q6UXN2	200 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	ASCL4	Q6XD76	172 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	OSR2	Q8N2R0	312 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	ZNF596	Q8TC21	504 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	SCN3B	Q9NY72	215 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	FAM172BP	A6NC97	362 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	PTGES3L	E9PB15	166 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	F2RL2	O00254	374 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	GPX5	O75715	221 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	CEL	P19835	753 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	NFYB	P25208	207 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	GLP1R	P43220	463 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	KIR2DS4	P43632	304 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	PRRX1	P54821	245 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	KRTAP10-3	P60369	221 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	PIFO	Q8TCI5	191 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	MYDGF	Q969H8	173 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	OR14A2	Q96R54	314 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	IL36G	Q9NZH8	169 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	DPM3	Q9P2X0	92 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	KIF25	Q9UIL4	384 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	TCF19	Q9Y242	345 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-228	ENST00000637325	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	CHST1	O43916	411 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	MAS1	P04201	325 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	CDK1	P06493	297 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	KCNJ3	P48549	501 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	ARHGDIB	P52566	201 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	AQP4	P55087	323 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	GPR176	Q14439	515 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	C11orf88	Q6PI97	169 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	LINC00596	Q86U02	117 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	TMEM219	Q86XT9	240 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325		Q8NFD4	153 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	THRSP	Q92748	146 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	MND1	Q9BWT6	205 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325		A6NDX4	124 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	ERICH4	A6NGS2	130 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	LEUTX	A8MZ59	168 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	CD1A	P06126	327 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	GTF2F2	P13984	249 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	FST	P19883	344 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	GDNF	P39905	211 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	CEACAM3	P40198	252 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	DYNLT3	P51808	116 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	BDH1	Q02338	343 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325		Q6ZTK2	550 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	NEK7	Q8TDX7	302 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	MUL1	Q969V5	352 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	DERL3	Q96Q80	235 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	VCX3B	Q9H321	246 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PNKP-228	ENST00000637325	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		11.13	□□□□□ -0.63

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