RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629179.1

PNKP-223, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, human

TSL 4

Gene PNKP, Length 811 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNKP-223	ENST00000629179	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		11.51	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	OSR2	Q8N2R0	312 aa		11.51	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		11.51	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	MUL1	Q969V5	352 aa		11.51	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		11.51	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	DUSP21	Q9H596	190 aa		11.51	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		11.51	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		11.51	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179		A0A1B0GUS0	222 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	FAM172BP	A6NC97	362 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	ATP6V1G2	O95670	118 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	CDK2	P24941	298 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	HSPA13	P48723	471 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	RAB13	P51153	203 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	SSX2	Q16385	188 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179		Q6ZSV7	163 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	PIFO	Q8TCI5	191 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	CNBD2	Q96M20	576 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	TMED9	Q9BVK6	235 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	SLITRK2	Q9H156	845 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	KIF25	Q9UIL4	384 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	RGS10	O43665	173 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	CRHBP	P24387	322 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	FAM189A2	Q15884	450 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	AANAT	Q16613	207 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	LYPD6	Q86Y78	171 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	LINC01006	Q8NI28	216 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	MALSU1	Q96EH3	234 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	CGB3	P0DN86	165 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	CGB7	P0DN87	165 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	GTF2F2	P13984	249 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	GLP1R	P43220	463 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	UTF1	Q5T230	341 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	AWAT2	Q6E213	333 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	OR52W1	Q6IF63	320 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	BRICD5	Q6PL45	260 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	CDH26	Q8IXH8	852 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	NDNF	Q8TB73	568 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	THRSP	Q92748	146 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	IFT22	Q9H7X7	185 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	RNF114	Q9Y508	228 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	VGLL3	A8MV65	326 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	TSPAN9	O75954	239 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	HSMCR30	P0CW71	290 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	NFYB	P25208	207 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	MAP2K4	P45985	399 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	KRTAP10-3	P60369	221 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	GPR50	Q13585	617 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	GPR176	Q14439	515 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		11.47	□□□□□ -0.57

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