RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610365.4

CYFIP1-203, Transcript of cytoplasmic FMR1 interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CYFIP1, Length 4,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1-203ENST00000610365 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP8.68□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 SNX22Q96L94 193 aa8.68□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 CALHM2Q9HA72 323 aa8.68□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa8.68□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 DOCK11Q5JSL3 2073 aa8.68□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 PGA4P0DJD7 388 aa8.68□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 PGA3P0DJD8 388 aa8.68□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 ZNF32P17041 273 aa8.68□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 CD82P27701 267 aa8.68□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 SPANXN5Q5MJ07 72 aa8.68□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 OSR2Q8N2R0 312 aa8.68□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 ZNF610Q8N9Z0 462 aa8.68□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 POM121Q96HA1 1249 aa8.68□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 SPIN2AQ99865 258 aa8.68□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa8.68□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 SLC25A31Q9H0C2 315 aa8.68□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 SMCO3A2RU48 225 aa8.68□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 CRYABP02511 175 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 FCGR3AP08637 254 aa8.68□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 HLA-GP17693 338 aa8.68□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 HOXA6P31267 233 aa8.68□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 HAAOP46952 286 aa8.68□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 UCNP55089 124 aa8.68□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 BTNL8Q6UX41 500 aa8.68□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 UFSP2Q9NUQ7 469 aa8.68□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 DOCK10Q96BY6 2186 aa8.67□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa8.67□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 EML5Q05BV3 1969 aa8.67□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 B4E171 279 aa8.67□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 C21orf140B9A014 251 aa8.67□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 SERPINA7P05543 415 aa8.67□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 TSPAN7P41732 249 aa8.67□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 GABRA4P48169 554 aa8.67□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 BATFQ16520 125 aa8.67□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 LTC4SQ16873 150 aa8.67□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 DOK5Q9P104 306 aa8.67□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 CD300LBA8K4G0 201 aa8.67□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 CHST1O43916 411 aa8.67□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 WDR1O75083 606 aa8.67□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 GALNSP34059 522 aa8.67□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 THBS4P35443 961 aa8.67□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 CEACAM16Q2WEN9 425 aa8.67□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 GFI1BQ5VTD9 330 aa8.67□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 LIAT1Q6ZQX7 453 aa8.67□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 GGACTQ9BVM4 153 aa8.67□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 ZNF587BE7ETH6 402 aa8.67□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 METTL15P1P0C7V9 234 aa8.67□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 OR1C1Q15619 314 aa8.67□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 PLPPR5Q32ZL2 321 aa8.67□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 LINC00469Q8N7U9 141 aa8.67□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa8.67□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 RASL10BQ96S79 203 aa8.67□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 CABLES2Q9BTV7 478 aa8.67□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 TMEM100Q9NV29 134 aa8.67□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 B3GAT1Q9P2W7 334 aa8.67□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa8.66□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa8.66□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa8.66□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 TUSC2O75896 110 aa8.66□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 PMP22Q01453 160 aa8.66□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 GFRALQ6UXV0 394 aa8.66□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 TMEM37Q8WXS4 190 aa8.66□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 PP6455Q8WZ26 134 aa8.66□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 EXTL1Q92935 676 aa8.66□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 PLPPR2Q96GM1 343 aa8.66□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 SSX3Q99909 188 aa8.66□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 SLC7A10Q9NS82 523 aa8.66□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 RNF150Q9ULK6 438 aa8.66□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 CYTIPO60759 359 aa8.66□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 IGLV3-19P01714 112 aa8.66□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 HNF1AP20823 631 aa8.66□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 P2RY1P47900 373 aa8.66□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 GPM6AP51674 278 aa8.66□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 QRFPP83859 136 aa8.66□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 TBC1D26Q86UD7 250 aa8.66□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 OR1K1Q8NGR3 316 aa8.66□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 OR6X1Q8NH79 312 aa8.66□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa8.66□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 CCL28Q9NRJ3 127 aa8.66□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 DBX1A6NMT0 343 aa8.66□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 TSTD3H0UI37 97 aa8.66□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 RNF224P0DH78 156 aa8.66□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 RND3P61587 244 aa8.66□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 FAM3AP98173 230 aa8.66□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 NHLH1Q02575 133 aa8.66□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 PHYHD1Q5SRE7 291 aa8.66□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa8.66□□□□□ -1.02
CYFIP1-203ENST00000610365 GAPTQ8N292 157 aa8.66□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.8 ms