RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596522.1

FCHO1-215, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 4

Gene FCHO1, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-215	ENST00000596522	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		11.66	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		11.66	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	TBX15	Q96SF7	602 aa		11.66	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		11.66	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		11.66	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		11.66	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	ODAM	A1E959	279 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	AIRE	O43918	545 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	FUT3	P21217	361 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	GADD45A	P24522	165 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	SCAND1	P57086	179 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	TAF9	Q16594	264 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	TMEM104	Q8NE00	496 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	NEK7	Q8TDX7	302 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	CORO2A	Q92828	525 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	PTX4	Q96A99	478 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	TM2D1	Q9BX74	207 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	OR51E2	Q9H255	320 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FCHO1-215	ENST00000596522		A0A1W2PP11	408 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	C17orf98	A8MV24	154 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	PDCD6	O75340	191 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	CLPX	O76031	633 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	UBE2E1	P51965	193 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	ZNF273	Q14593	569 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	OR52W1	Q6IF63	320 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	RAB12	Q6IQ22	244 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	FAM46B	Q96A09	425 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	SLC25A28	Q96A46	364 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	YIPF6	Q96EC8	236 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	GFI1	Q99684	422 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	BANF2	Q9H503	90 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	HSPB6	O14558	160 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	TCF21	O43680	179 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	SCGN	O76038	276 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	IGHV1-69	P01742	117 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	SMIM18	P0DKX4	95 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	RAB6A	P20340	208 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	QRFP	P83859	136 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	AES	Q08117	197 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	ARL6IP1	Q15041	203 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	P2RY14	Q15391	338 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522		Q8N7P7	452 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	LHX4	Q969G2	390 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	COQ2	Q96H96	371 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	RAB22A	Q9UL26	194 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	POM121C	A8CG34	1229 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	GZMH	P20718	246 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	SDC2	P34741	201 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	GLP1R	P43220	463 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	UNC119	Q13432	240 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	MIDN	Q504T8	468 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	C6orf183	Q5T699	404 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	HES5	Q5TA89	166 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	OCEL1	Q9H607	264 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	ETAA1	Q9NY74	926 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	SHISA3	A0PJX4	238 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	IL1A	P01583	271 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	CCL3L1	P16619	93 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	GLIPR1	P48060	266 aa		11.61	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms