RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 MYCNOSP40205 109 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 CDK5R1Q15078 307 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 CHPT1Q8WUD6 406 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 DUX3Q96PT4 197 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 NEK6Q9HC98 313 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 OR6C3Q9NZP0 311 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 H0YHG0 523 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 CGB3P0DN86 165 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 CGB7P0DN87 165 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 HES1Q14469 280 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 ZFP57Q9NU63 452 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 ENOPH1Q9UHY7 261 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 SERPINE3A8MV23 424 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 J3QR06 171 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 HSPB6O14558 160 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 DEGS1O15121 323 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 MT-ND2P03891 347 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM11P17152 192 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 GLP1RP43220 463 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 TMED1Q13445 227 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 HNF4GQ14541 408 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 SAXO1Q8IYX7 474 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 OR8J1Q8NGP2 316 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 OR13A1Q8NGR1 328 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 TFAP2CQ92754 450 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 HRASLS5Q96KN8 279 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 RHOFQ9HBH0 211 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 CALYQ9NYX4 217 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC6A1P30531 599 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 DGCR2P98153 550 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 FDX2Q6P4F2 183 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 AMIGO2Q86SJ2 522 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 OR51T1Q8NGJ9 327 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 OR13C3Q8NGS6 347 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 GABARAPL3Q9BY60 117 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 RIBC2Q9H4K1 309 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 FGF16O43320 207 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 ZP1P60852 638 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 RFKQ969G6 155 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 KIF25Q9UIL4 384 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 PSG11Q9UQ72 335 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 MYRFQ9Y2G1 1151 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 H0YJX3 145 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 IGKV1D-33P01593 117 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 IGKV1-33P01594 117 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 IGHG2P01859 326 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 GNG10P50151 68 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 MADCAM1Q13477 382 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 LTC4SQ16873 150 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC35E3Q7Z769 313 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF695Q8IW36 515 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 STPG2Q8N412 459 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 RAX2Q96IS3 184 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 MEIKINA0A087WXM9 373 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC01548A6NM66 108 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC16A6O15403 523 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 IL1AP01583 271 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 HTR1AP08908 422 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM225BP0DP42 221 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 FASP25445 335 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 CCR9P51686 369 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC35B1P78383 322 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 COMMD1Q8N668 190 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF565Q8N9K5 539 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 OSBPL10Q9BXB5 764 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC00574Q9H8X3 128 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 U3KQK5 164 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAV24A0A0B4J272 114 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 OR4C45A6NMZ5 311 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 J3QRE1 110 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB7AP51149 207 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 LUMP51884 338 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB25P57735 213 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 OR8H3Q8N146 312 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 DAPL1A0PJW8 107 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 CCL24O00175 119 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 HCKP08631 526 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 DBTP11182 482 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 MTNR1BP49286 362 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 KISS1Q15726 138 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 FOXRED2Q8IWF2 684 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 RFESDQ8TAC1 157 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-211ENST00000590874 MRGPRDQ8TDS7 321 aa20.17■□□□□ 0.82
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