RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565712.1

C15orf40-211, Transcript of chromosome 15 open reading frame 40, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene C15orf40, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40-211ENST00000565712 MEGF11A6BM72 1044 aa11.93□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 ODF3BA8MYP8 253 aa11.93□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 HSPB6O14558 160 aa11.93□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 GTF2F2P13984 249 aa11.93□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 OMGP23515 440 aa11.93□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 RAG2P55895 527 aa11.93□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 RBM11P57052 281 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa11.93□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 SLC22A6Q4U2R8 563 aa11.93□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 ACSM3Q53FZ2 586 aa11.93□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 ZNF626Q68DY1 528 aa11.93□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa11.93□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 HEPN1Q6WQI6 88 aa11.93□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP11.93□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 MUL1Q969V5 352 aa11.93□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 SSX3Q99909 188 aa11.93□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 TMED9Q9BVK6 235 aa11.93□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 TMEM133Q9H2Q1 129 aa11.93□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa11.93□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 BEX1Q9HBH7 125 aa11.93□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 ISYNA1Q9NPH2 558 aa11.93□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 ING3Q9NXR8 418 aa11.93□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 TENM1Q9UKZ4 2725 aa11.92□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa11.92□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa11.92□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 H3BUX3 64 aa11.92□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 HSMCR30P0CW71 290 aa11.92□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 MDKP21741 143 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 MPV17LQ2QL34 196 aa11.92□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 AWAT2Q6E213 333 aa11.92□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa11.92□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa11.92□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 ZNF565Q8N9K5 539 aa11.92□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 OR4D6Q8NGJ1 314 aa11.92□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 MALSU1Q96EH3 234 aa11.92□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 UQCC2Q9BRT2 126 aa11.92□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 CLEC7AQ9BXN2 247 aa11.92□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 TCF7L1Q9HCS4 588 aa11.92□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 MEIKINA0A087WXM9 373 aa11.91□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 MMP23AO75900 390 aa11.91□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 CDK2P24941 298 aa11.91□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 RELBQ01201 579 aa11.91□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 PAX5Q02548 391 aa11.91□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 TPBGQ13641 420 aa11.91□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 INSL4Q14641 139 aa11.91□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 MINOS1Q5TGZ0 78 aa11.91□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa11.91□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 LIPKQ5VXJ0 399 aa11.91□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 SHISA2Q6UWI4 295 aa11.91□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 CEACAM19Q7Z692 300 aa11.91□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 RTN4RL2Q86UN3 420 aa11.91□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 SUMF2Q8NBJ7 301 aa11.91□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 PHYHIPQ92561 330 aa11.91□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 Q9H521 79 aa11.91□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa11.91□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa11.9□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 CLPSL1A2RUU4 121 aa11.9□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 VGLL3A8MV65 326 aa11.9□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 SC5DO75845 299 aa11.9□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 GLP1RP43220 463 aa11.9□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 TRAM1Q15629 374 aa11.9□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 C17orf58Q2M2W7 97 aa11.9□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 HSD17B12Q53GQ0 312 aa11.9□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 ATAD3CQ5T2N8 411 aa11.9□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 OLFML2AQ68BL7 652 aa11.9□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 GLT8D1Q68CQ7 371 aa11.9□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 LYPD6Q86Y78 171 aa11.9□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 ABHD12Q8N2K0 398 aa11.9□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 ZNF596Q8TC21 504 aa11.9□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 SLITRK2Q9H156 845 aa11.9□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 SPACA1Q9HBV2 294 aa11.9□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 RAB18Q9NP72 206 aa11.9□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 GHRLQ9UBU3 117 aa11.9□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 KIF25Q9UIL4 384 aa11.9□□□□□ -0.5
C15orf40-211ENST00000565712 A0A1W2PP11 408 aa11.89□□□□□ -0.51
C15orf40-211ENST00000565712 CPEP16870 476 aa11.89□□□□□ -0.51
C15orf40-211ENST00000565712 SRMP19623 302 aa11.89□□□□□ -0.51
C15orf40-211ENST00000565712 PAX6P26367 422 aa11.89□□□□□ -0.51
C15orf40-211ENST00000565712 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
C15orf40-211ENST00000565712 FAM189A2Q15884 450 aa11.89□□□□□ -0.51
C15orf40-211ENST00000565712 SSX2Q16385 188 aa11.89□□□□□ -0.51
C15orf40-211ENST00000565712 LY6EQ16553 131 aa11.89□□□□□ -0.51
C15orf40-211ENST00000565712 FAM27D1Q5T7N8 215 aa11.89□□□□□ -0.51
C15orf40-211ENST00000565712 SLC35E4Q6ICL7 350 aa11.89□□□□□ -0.51
C15orf40-211ENST00000565712 LIAT1Q6ZQX7 453 aa11.89□□□□□ -0.51
C15orf40-211ENST00000565712 OR13A1Q8NGR1 328 aa11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms