RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 CT45A10P0DMU9 189 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 BRS3P32247 399 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 LSM6P62312 80 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 GAB4Q2WGN9 574 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 SLC25A34Q6PIV7 304 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 BRICD5Q6PL45 260 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 C3orf56Q8N813 242 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 OR13C8Q8NGS7 320 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 CXCL16Q9H2A7 254 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 SMOC1Q9H4F8 434 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 SEMA5BQ9P283 1151 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 PIGLQ9Y2B2 252 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 C9orf172C9J069 976 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 M0R1B8 84 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF195O14628 629 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 ATP5LO75964 103 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 FURINP09958 794 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 PTHLHP12272 177 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 TFPI2P48307 235 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 PSMB3P49720 205 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 CAV3P56539 151 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 CLDN15P56746 228 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 HSD52Q0P140 79 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 IGDCC3Q8IVU1 814 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 WBP2Q969T9 261 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 FAM110AQ9BQ89 295 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 RHNO1Q9BSD3 238 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 FLRT3Q9NZU0 649 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 TNFSF18Q9UNG2 199 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 ETV7Q9Y603 341 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 ATAD5Q96QE3 1844 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 EPOPA6NHQ4 379 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 NME4O00746 187 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 PSG1P11464 419 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 FOLR1P15328 257 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF90Q03938 601 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 NKG7Q16617 165 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 SGPP2Q8IWX5 399 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF441Q8N8Z8 693 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 OR11H7Q8NGC8 314 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 OR1K1Q8NGR3 316 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 HSPB9Q9BQS6 159 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 TLNRD1Q9H1K6 362 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM38AQ9H6F2 299 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 PARP11Q9NR21 331 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 ACER3Q9NUN7 267 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 CSAG2Q9Y5P2 127 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1W2PQF6 199 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 M0R082 166 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 BMPR1BO00238 502 aa5.57□□□□□ -1.52
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PTPRB-210ENST00000551525 CRISP2P16562 243 aa5.57□□□□□ -1.52
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PTPRB-210ENST00000551525 ISL1P61371 349 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 SLC35B1P78383 322 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 CATR1Q13166 79 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 FAM71E1Q6IPT2 247 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 LINC00346Q8IVM7 164 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 SPACA3Q8IXA5 215 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 SCCPDHQ8NBX0 429 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 MYO7AQ13402 2215 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 OOEPA6NGQ2 149 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 PRR19A6NJB7 356 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 B5MCH6 92 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 CFDP00746 253 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 SCGB1C2P0DMR2 95 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 RAB32Q13637 225 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 MIDNQ504T8 468 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM136Q6ZRR5 245 aa5.57□□□□□ -1.52
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PTPRB-210ENST00000551525 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 GPR148Q8TDV2 347 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 ABHD6Q9BV23 337 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 DUSP13Q9UII6 198 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 SLC45A2Q9UMX9 530 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 URB1O60287 2271 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 GABARAPH6UMI1 98 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 GPR137BO60478 399 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 MPC2O95563 127 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 SLC6A1P30531 599 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 FBXW9Q5XUX1 488 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 COLCA1Q6ZS62 124 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 MRGPRGQ86SM5 289 aa5.57□□□□□ -1.52
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