RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549076.1

ARFGAP1-222, Transcript of ADP ribosylation factor GTPase activating protein 1, human

TSL 2

Gene ARFGAP1, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARFGAP1-222	ENST00000549076	KCNJ3	P48549	501 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076		Q8N2B8	174 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	OR52N1	Q8NH53	320 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	CFHR4	Q92496	578 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	SMIM19	Q96E16	107 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	COQ2	Q96H96	371 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	METTL9	Q9H1A3	318 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	ZNF702P	Q9H963	129 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	ING4	Q9UNL4	249 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	MEGF11	A6BM72	1044 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	NFYB	P25208	207 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	CD34	P28906	385 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	BDKRB2	P30411	391 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	GLP1R	P43220	463 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	RCN1	Q15293	331 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	DDI2	Q5TDH0	399 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	XAF1	Q6GPH4	301 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	ASCL4	Q6XD76	172 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	GHSR	Q92847	366 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	FAM172BP	A6NC97	362 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	EFCAB10	A6NFE3	127 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	FBXO24	O75426	580 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	IGLV1-47	P01700	117 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	MNDA	P41218	407 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	RIPK1	Q13546	671 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076		Q8NFD4	153 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	OR9G1	Q8NH87	305 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	VCX	Q9H320	206 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	KIF25	Q9UIL4	384 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ARFGAP1-222	ENST00000549076		A0A087X0M5	115 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076		A0A1B0GX30	115 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	OOSP1	A8MZH6	123 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	CDRT1	O95170	752 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	OR3A4P	P47883	348 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	TAS2R43	P59537	309 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	ST3GAL4	Q11206	333 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	PIGY	Q3MUY2	71 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076		Q499Y3	187 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	LINC00596	Q86U02	117 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	OSR2	Q8N2R0	312 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	CALY	Q9NYX4	217 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	IL36G	Q9NZH8	169 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	GDNF	P39905	211 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	CAPG	P40121	348 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	BLCAP	P62952	87 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	PAX5	Q02548	391 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	GPR176	Q14439	515 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	STX19	Q8N4C7	294 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	GGH	Q92820	318 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	RPE	Q96AT9	228 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	KIRREL1	Q96J84	757 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	OR5M11	Q96RB7	305 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	IFT22	Q9H7X7	185 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	MYL12B	O14950	172 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	IL1A	P01583	271 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	OPN1MW	P04001	364 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	FAM106CP	P0CH98	169 aa		13.56	□□□□□ -0.24

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