RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547201.5

USP25-209, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, human

TSL 2

Gene USP25, Length 757 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP25-209	ENST00000547201	SERPINA2	P20848	420 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	TUBG1	P23258	451 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	GLRA1	P23415	457 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	GABRA5	P31644	462 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	ALDH3B2	P48448	385 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	PITPNB	P48739	271 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	MTCP1	P56278	107 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	SELENOV	P59797	346 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	MXD1	Q05195	221 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	IL24	Q13007	206 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	SPCS2	Q15005	226 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	HCP5	Q6MZN7	132 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201		Q8N7P7	452 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	PP6455	Q8WZ26	134 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	ST8SIA4	Q92187	359 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	BORCS8	Q96FH0	119 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	SNX22	Q96L94	193 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	CEP19	Q96LK0	163 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	TECTB	Q96PL2	329 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	TBX15	Q96SF7	602 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	PPA2	Q9H2U2	334 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	TMEM210	A6NLX4	147 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201		A8MXK9	166 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	CCRL2	O00421	344 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	MGST3	O14880	152 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	LDLRAD4	O15165	306 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	SIGLEC5	O15389	551 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	NXPH2	O95156	264 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	TNFAIP8	O95379	198 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	OR2H2	O95918	312 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	HAND1	O96004	215 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	HEXA	P06865	529 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	MSMB	P08118	114 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	MMP9	P14780	707 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	CD36	P16671	472 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	RAB3A	P20336	220 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	BDKRB2	P30411	391 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	GABRA2	P47869	451 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	FUT6	P51993	359 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	DLX6	P56179	175 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	TAS2R43	P59537	309 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	VBP1	P61758	197 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	EDDM3A	Q14507	147 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	ASCL4	Q6XD76	172 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	OR51F2	Q8NH61	342 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	PKIB	Q9C010	78 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201		Q9H521	79 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	NEK6	Q9HC98	313 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	HMG20A	Q9NP66	347 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
USP25-209	ENST00000547201	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		4.52	□□□□□ -1.69
USP25-209	ENST00000547201	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		4.52	□□□□□ -1.69
USP25-209	ENST00000547201	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		4.52	□□□□□ -1.69
USP25-209	ENST00000547201	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		4.52	□□□□□ -1.69
USP25-209	ENST00000547201	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		4.52	□□□□□ -1.69
USP25-209	ENST00000547201	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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