RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 OR51T1Q8NGJ9 327 aa4.58□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 OR5D18Q8NGL1 313 aa4.58□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 APH1BQ8WW43 257 aa4.58□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 CORO2AQ92828 525 aa4.58□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 TNFRSF14Q92956 283 aa4.58□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 RFT1Q96AA3 541 aa4.58□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 AJUBAQ96IF1 538 aa4.58□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
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CLSTN3-215ENST00000544584 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 CHST6Q9GZX3 395 aa4.58□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM133Q9H2Q1 129 aa4.58□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 C16orf95Q9H693 158 aa4.58□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 IFT22Q9H7X7 185 aa4.58□□□□□ -1.68
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CLSTN3-215ENST00000544584 KCNIP1Q9NZI2 227 aa4.58□□□□□ -1.68
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CLSTN3-215ENST00000544584 RNF114Q9Y508 228 aa4.58□□□□□ -1.68
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CLSTN3-215ENST00000544584 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa4.57□□□□□ -1.68
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CLSTN3-215ENST00000544584 A0A1W2PRF3 423 aa4.57□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A1W2PRM7 423 aa4.57□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa4.57□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 H3BUX3 64 aa4.57□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 PDCD5O14737 125 aa4.57□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 PSPNO60542 156 aa4.57□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
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CLSTN3-215ENST00000544584 MAS1P04201 325 aa4.57□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 CDK1P06493 297 aa4.57□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 AMY2BP19961 511 aa4.57□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 SERPINA2P20848 420 aa4.57□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 CDK2P24941 298 aa4.57□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 DUSP1P28562 367 aa4.57□□□□□ -1.68
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CLSTN3-215ENST00000544584 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 SNU13P55769 128 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 RBM11P57052 281 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 PAX5Q02548 391 aa4.57□□□□□ -1.68
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CLSTN3-215ENST00000544584 SPHARQ15513 63 aa4.57□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 MED22Q15528 200 aa4.57□□□□□ -1.68
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CLSTN3-215ENST00000544584 C2orf68Q2NKX9 166 aa4.57□□□□□ -1.68
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CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF529Q6P280 563 aa4.57□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 BATF2Q8N1L9 274 aa4.57□□□□□ -1.68
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CLSTN3-215ENST00000544584 Q8NFD4 153 aa4.57□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 OR52N4Q8NGI2 321 aa4.57□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 OR10X1Q8NGY0 326 aa4.57□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 OR9G1Q8NH87 305 aa4.57□□□□□ -1.68
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CLSTN3-215ENST00000544584 SPACA5Q96QH8 159 aa4.57□□□□□ -1.68
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CLSTN3-215ENST00000544584 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 ACOT13Q9NPJ3 140 aa4.57□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 TAS2R4Q9NYW5 299 aa4.57□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 C1RLQ9NZP8 487 aa4.57□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 FBLN5Q9UBX5 448 aa4.57□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 AASSQ9UDR5 926 aa4.57□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 RAB26Q9ULW5 256 aa4.57□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 VWFP04275 2813 aa4.56□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa4.56□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM82A0PJX8 343 aa4.56□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 E9PI62 339 aa4.56□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 AIPO00170 330 aa4.56□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 TXNL1O43396 289 aa4.56□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 XPNPEP2O43895 674 aa4.56□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 IL1AP01583 271 aa4.56□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 GNAO1P09471 354 aa4.56□□□□□ -1.68
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