RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537002.5

PTPRD-213, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,224 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-213ENST00000537002 ABI3Q9P2A4 366 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 DIRC3C9JPN6 131 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 VENTXO95231 258 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 EPPINO95925 133 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 DCAF7P61962 342 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 ATP6V1FQ16864 119 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 HLA-DRB5Q30154 266 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 SPATA45Q537H7 98 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 APH1AQ96BI3 265 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 YPEL4Q96NS1 127 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 MMP25Q9NPA2 562 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 FLRT3Q9NZU0 649 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 ANAPC10Q9UM13 185 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 A0A1W2PPE3 182 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 MASP2O00187 686 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 SOCS1O15524 211 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 UPK3AO75631 287 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 MPZL1O95297 269 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 APLNRP35414 380 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 DEFB103AP81534 67 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 RUNX1Q01196 453 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 METRNLQ641Q3 311 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 IL21Q9HBE4 155 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 G3V3Y1 287 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 TYMSP04818 313 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 PGA3P0DJD8 388 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 TMEM11P17152 192 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 ATP6V0CP27449 155 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 TCL1AP56279 114 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 SLC38A11Q08AI6 406 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 IL15RAQ13261 267 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 TMEM52BQ4KMG9 183 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 FFAR4Q5NUL3 377 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 OR2A1Q8NGT9 310 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 GFI1Q99684 422 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 LPAR5Q9H1C0 372 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 OR2W5A6NFC9 320 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 LDLRAD4O15165 306 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 LYZL2Q7Z4W2 148 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 OR2AE1Q8NHA4 323 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 RDH5Q92781 318 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 PECRQ9BY49 303 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 A0A1B0GU03 582 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 B4E171 279 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 M0R2Z0 102 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 NPEPL1Q8NDH3 523 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 OR10G9Q8NGN4 311 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 OR10G7Q8NGN6 311 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 OR2I1PQ8NGU4 316 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 RLN3Q8WXF3 142 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 HSPB9Q9BQS6 159 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 FAAP24Q9BTP7 215 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 OR1A1Q9P1Q5 309 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 SIRPB1O00241 398 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 PITX3O75364 302 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 CNN1P51911 297 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 FAM162BQ5T6X4 162 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 PRAMEF20Q5VT98 475 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 Q6ZSR6 202 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 APCDD1LQ8NCL9 501 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 BHLHE23Q8NDY6 225 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 ERGIC1Q969X5 290 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 SH3BGRL3Q9H299 93 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 CDH20Q9HBT6 801 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 LHX9Q9NQ69 397 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 UQCR10Q9UDW1 63 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 CLDN16Q9Y5I7 305 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 BMPR1BO00238 502 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 OR5G3P0C626 314 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 CEACAM1P13688 526 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 FUT3P21217 361 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 FUT5Q11128 374 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 RUNX3Q13761 415 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 DEFB133Q30KQ1 61 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 ZNF260Q3ZCT1 412 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 C16orf52Q8NHV5 167 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 TMEM170AQ8WVE7 144 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 C11orf40Q8WZ69 217 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 PYGO2Q9BRQ0 406 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 ST3GAL6Q9Y274 331 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 RRP8O43159 456 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 EDDM3BP56851 147 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 CACNA1CQ13936 2221 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 PNKDQ8N490 385 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRD-213ENST00000537002 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
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