RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531895.5

ANKRD42-208, Transcript of ankyrin repeat domain 42, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD42, Length 1,887 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42-208ENST00000531895 SIRPB1O00241 398 aa13.08□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 TFF1P04155 84 aa13.08□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 ZNF44P15621 663 aa13.08□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 S100A1P23297 94 aa13.08□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 GNRHRP30968 328 aa13.08□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 ZNF146Q15072 292 aa13.08□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 SPRNQ5BIV9 151 aa13.08□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 C6orf183Q5T699 404 aa13.08□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 DMRTA2Q96SC8 542 aa13.08□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 SLC2A9Q9NRM0 540 aa13.08□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 MBD2Q9UBB5 411 aa13.08□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 Q9UFV3 132 aa13.08□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 ATP23Q9Y6H3 246 aa13.08□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa13.07□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 BET1O15155 118 aa13.07□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 OR5AC1P0C628 307 aa13.07□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 IGKV1-13P0DP09 117 aa13.07□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 PSMB6P28072 239 aa13.07□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 CCKARP32238 428 aa13.07□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 ZNF718Q3SXZ3 478 aa13.07□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 SGPP2Q8IWX5 399 aa13.07□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 KCNRGQ8N5I3 272 aa13.07□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 TLNRD1Q9H1K6 362 aa13.07□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 NAA60Q9H7X0 242 aa13.07□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 RHOFQ9HBH0 211 aa13.07□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 SPACA1Q9HBV2 294 aa13.07□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 COMMD9Q9P000 198 aa13.07□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa13.07□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 TMEM210A6NLX4 147 aa13.06□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 TUSC2O75896 110 aa13.06□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 GLAP06280 429 aa13.06□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 FAM87AP0C7U9 286 aa13.06□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 BMP5P22003 454 aa13.06□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 PIK3IP1Q96FE7 263 aa13.06□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 GALNT14Q96FL9 552 aa13.06□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 C2orf50Q96LR7 162 aa13.06□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 GPHA2Q96T91 129 aa13.06□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 CXXC4Q9H2H0 198 aa13.06□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 RASL12Q9NYN1 266 aa13.06□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 UBQLN2Q9UHD9 624 aa13.06□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa13.06□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 LINC00862A6NCI5 91 aa13.06□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 SNAPC5O75971 98 aa13.06□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 NXPH2O95156 264 aa13.06□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 SLC34A2O95436 690 aa13.06□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 IFNA7P01567 189 aa13.06□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 TUBG1P23258 451 aa13.06□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 GLP1RP43220 463 aa13.06□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 WDR82Q6UXN9 313 aa13.06□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 GAPTQ8N292 157 aa13.06□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 OR5T2Q8NGG2 359 aa13.06□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 LHFPL5Q8TAF8 219 aa13.06□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 GLYATL2Q8WU03 294 aa13.06□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 TUBG2Q9NRH3 451 aa13.06□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 ASF1BQ9NVP2 202 aa13.06□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 C1orf123Q9NWV4 160 aa13.06□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 OR5AC2Q9NZP5 309 aa13.06□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 ZNF835Q9Y2P0 537 aa13.06□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 MAB21L2Q9Y586 359 aa13.06□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 LEUTXA8MZ59 168 aa13.05□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 PSPNO60542 156 aa13.05□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 RP2O75695 350 aa13.05□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 LYL1P12980 280 aa13.05□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 RAB32Q13637 225 aa13.05□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 CLLU1Q5K131 121 aa13.05□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 GGNBP1Q5YKI7 109 aa13.05□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 Q8IYB0 196 aa13.05□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 SLC38A6Q8IZM9 456 aa13.05□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 UFSP2Q9NUQ7 469 aa13.05□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 AUP1Q9Y679 476 aa13.05□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 MSGN1A6NI15 193 aa13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 B3GALNT1O75752 331 aa13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 GCH1P30793 250 aa13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 ZNF345Q14585 488 aa13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 ALKAL2Q6UX46 152 aa13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 ZNF497Q6ZNH5 498 aa13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 TP53RKQ96S44 253 aa13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 OR2F2O95006 317 aa13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 ZNF250P15622 560 aa13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 C4BPBP20851 252 aa13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 HERV-K104P61576 105 aa13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms