RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 ADAM5Q6NVV9 412 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 MDS2Q8NDY4 140 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 OR5L1Q8NGL2 311 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 TAF9BQ9HBM6 251 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 MED6O75586 246 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 SCGB1D2O95969 90 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 PET100P0DJ07 73 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 RAB5BP61020 215 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 RHOVQ96L33 236 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 ZNF488Q96MN9 340 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 ZNF732B4DXR9 585 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 NME2P1O60361 137 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 CLN5O75503 358 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 SLC10A1Q14973 349 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 NRN1LQ496H8 165 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 ABCA11PQ4W5N1 156 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 LYZL2Q7Z4W2 148 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 MCEMP1Q8IX19 187 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 LOXL4Q96JB6 756 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 POM121L2Q96KW2 1035 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 ZNF251Q9BRH9 671 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 ZNF286AQ9HBT8 521 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 MTCH1Q9NZJ7 389 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 C5orf52A6NGY3 159 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 SYNGR1O43759 233 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 HKR1P10072 659 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 AADACP22760 399 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 TMEM187Q14656 261 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 DMBX1Q8NFW5 382 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 EXTL1Q92935 676 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 HIST1H2BAQ96A08 127 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 GPHA2Q96T91 129 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 MEMO1Q9Y316 297 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 WISP2O76076 250 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 OR8U9P0C7N5 309 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 RNF224P0DH78 156 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 PMP22Q01453 160 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 OR8U1Q8NH10 309 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 SEC11CQ9BY50 192 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 NAA60Q9H7X0 242 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 SLC2A9Q9NRM0 540 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 SPRR3Q9UBC9 169 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 AMDHD2Q9Y303 409 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 LAMA5O15230 3695 aa11.02□□□□□ -0.64
PRAME-213ENST00000492657 ZNF724A8MTY0 619 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 C1orf196B1AJZ1 125 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 DIRAS3O95661 229 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 IFNA4P05014 189 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 WNT5AP41221 380 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 SPATA46Q5T0L3 261 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 IL34Q6ZMJ4 242 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 FAM24BQ8N5W8 94 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 DNAJB11Q9UBS4 358 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 A0A1W2PR80 420 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 K7EPK0 472 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 M0R036 132 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 YIF1AO95070 293 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 RPL12P30050 165 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 ECI1P42126 302 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 FHITP49789 147 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 TSC22D1Q15714 1073 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 TMEM9BQ9NQ34 198 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 GTF3C1Q12789 2109 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 CD300LBA8K4G0 201 aa11.01□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 NUDT19A8MXV4 375 aa11.01□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 IL18BPO95998 194 aa11.01□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 IFNA21P01568 189 aa11.01□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 CAV2P51636 162 aa11.01□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 CEACAM21Q3KPI0 293 aa11.01□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 PDZD11Q5EBL8 140 aa11.01□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 C10orf91Q5T1B1 145 aa11.01□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 SMIM8Q96KF7 97 aa11.01□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa11.01□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa11.01□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 A0A1W2PPE2 198 aa11.01□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 SCTP09683 121 aa11.01□□□□□ -0.65
PRAME-213ENST00000492657 OR8U8P0C7N1 319 aa11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms