RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 FAM183AA6NL82 134 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 TRPC5OSA6NMA1 111 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 ENTPD6O75354 484 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 CA2P00918 260 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 IGHG2P01859 326 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 CD5P06127 495 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 GP1BAP07359 652 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 OR10A3P58181 314 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 FMODQ06828 376 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 IL15RAQ13261 267 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 FAM162BQ5T6X4 162 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 DPPA2Q7Z7J5 298 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 COMTD1Q86VU5 262 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 SPATA24Q86W54 205 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 FAAP24Q9BTP7 215 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 MS4A12Q9NXJ0 267 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 TAS2R13Q9NYV9 303 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 PTPRMP28827 1452 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 DIP2BQ9P265 1576 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 TCF21O43680 179 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 GTF2F2P13984 249 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 AKR1C4P17516 323 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 PYCR1P32322 319 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 KDELR2P33947 212 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 SLC25A45Q8N413 288 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 OR2K2Q8NGT1 345 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 DTD1Q8TEA8 209 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 DDIT4LQ96D03 193 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 NDEL1Q9GZM8 345 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 RHOFQ9HBH0 211 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 TAS2R1Q9NYW7 299 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 COMMD9Q9P000 198 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 CLASP1Q7Z460 1538 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 F8VZ95 297 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 MKRN2OSH3BPM6 223 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 SCN2BO60939 215 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 SPNP16150 400 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 ATF1P18846 271 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 CNTFRP26992 372 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 PLTPP55058 493 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 PMS2P3Q13401 168 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 PAGE2Q7Z2X7 111 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 CRLF3Q8IUI8 442 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 OR4C13Q8NGP0 309 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 ISLRO14498 428 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 BRI3O95415 125 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP10-8P60410 259 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 RHOAP61586 193 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 SLAMF1Q13291 335 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 OLIG3Q7RTU3 272 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 OTUD6BQ8N6M0 293 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 GATD1Q8NB37 220 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 OR5AK3PQ8NH89 298 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 OR2V2Q96R30 315 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 F5H5P2 479 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 UGT2B11O75310 529 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 LIMS3P0CW19 117 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 LIMS4P0CW20 117 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF35P13682 527 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 C1QTNF8P60827 252 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 CPNE9Q8IYJ1 553 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 RPRMLQ8N4K4 120 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 C3orf22Q8N5N4 141 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 CLDN23Q96B33 292 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 BBS2Q9BXC9 721 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 TXNIPQ9H3M7 391 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 IQSEC2Q5JU85 1478 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 PHYHO14832 338 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 SEC16AO15027 2179 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 YEATS4O95619 227 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 INAFM2P0DMQ5 153 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 ZIC4Q8N9L1 334 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF721Q8TF20 911 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 FXYD5Q96DB9 178 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 PYURFQ96I23 114 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 ANGPTL4Q9BY76 406 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 ASCL3Q9NQ33 180 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 C1orf109Q9NX04 203 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF492Q9P255 531 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 POMPQ9Y244 141 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 ATRNO75882 1429 aa4.07□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms