RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		14.09	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00596	Q86U02	117 aa		14.09	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		14.09	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	OSR2	Q8N2R0	312 aa		14.09	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC01006	Q8NI28	216 aa		14.09	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	MUL1	Q969V5	352 aa		14.09	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	14.09	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	CITED1	Q99966	193 aa		14.09	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		14.09	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	SSR3	Q9UNL2	185 aa		14.09	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		14.08	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		14.08	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	CDRT1	O95170	752 aa		14.08	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	TFF1	P04155	84 aa		14.08	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	DUSP1	P28562	367 aa		14.08	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	IL13RA2	Q14627	380 aa		14.08	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	SSX1	Q16384	188 aa		14.08	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	TAF9	Q16594	264 aa		14.08	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		14.08	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		14.08	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	14.08	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		14.08	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF144B	Q7Z419	303 aa		14.08	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	OR8H2	Q8N162	312 aa		14.08	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB18	Q9NP72	206 aa		14.08	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF114	Q9Y508	228 aa		14.08	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		14.07	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	VGLL3	A8MV65	326 aa		14.07	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	TIMM23	O14925	209 aa		14.07	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	SERPINA2	P20848	420 aa		14.07	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	14.07	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	GRK1	Q15835	563 aa		14.07	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		14.07	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		14.07	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		14.07	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		14.07	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	CST11	Q9H112	138 aa		14.07	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		14.07	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		14.07	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	STUB1	Q9UNE7	303 aa		14.07	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		14.07	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	14.07	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	SIRPB1	O00241	398 aa		14.06	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	MGST3	O14880	152 aa		14.06	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	OR2H2	O95918	312 aa		14.06	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF728	P0DKX0	622 aa		14.06	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	OMG	P23515	440 aa		14.06	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	LMO1	P25800	156 aa		14.06	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	DLX6	P56179	175 aa		14.06	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	EDDM3B	P56851	147 aa		14.06	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	PROK1	P58294	105 aa		14.06	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		14.06	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	14.06	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		14.06	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	TREML4	Q6UXN2	200 aa		14.06	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		14.06	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424		Q8NFD4	153 aa		14.06	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		14.06	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		14.06	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	AJUBA	Q96IF1	538 aa		14.06	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		14.06	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		14.06	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		14.05	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	hADV38S2	A0JD32	116 aa		14.05	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		14.05	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	HTR2C	P28335	458 aa		14.05	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	LGALS4	P56470	323 aa		14.05	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	KLRD1	Q13241	179 aa		14.05	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	MPV17L	Q2QL34	196 aa		14.05	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		14.05	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		14.05	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424		Q6ZSV7	163 aa		14.05	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		14.05	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	MALSU1	Q96EH3	234 aa		14.05	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		14.05	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	14.05	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	14.05	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		14.05	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		14.05	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		14.05	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A0G2JK05	382 aa		14.04	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424		M0QZ24	198 aa		14.04	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	14.04	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	14.04	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	CD36	P16671	472 aa		14.04	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	14.04	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	KIR2DS4	P43632	304 aa		14.04	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNJ3	P48549	501 aa		14.04	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	14.04	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	14.04	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	EDDM3A	Q14507	147 aa		14.04	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		14.04	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	14.04	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	C22orf42	Q6IC83	251 aa		14.04	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		14.04	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		14.04	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		14.04	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	14.04	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	SSX3	Q99909	188 aa		14.04	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	CHST6	Q9GZX3	395 aa		14.04	□□□□□ -0.16

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